24小时热门版块排行榜    

查看: 2967  |  回复: 19

liuxing1-1

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 土壤总细菌16S PCR-条带不亮的问题

本人打算做T-RFLP,现在正在做土壤总细菌16S PCR,引物是27F和1492R,PCR体系是:25ul体系:dNTP(10UM) 0.5ul, 引物(10UM)各1uL,Taq E 0.5ul,10×buffer缓冲液(5U/uL),模板0.5uL,以水补齐。PCR条件是94℃预变性5 min,94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1 min,30 个循环,72℃下延伸10min。按照这个条件,能够P出条带,但是问题是条带不亮,甚至marker都不亮。期间,也换过EB染色液、TAE,但问题依旧。大家帮忙分析一下是什么原因吧。


[ Last edited by liuxing1-1 on 2012-4-19 at 10:05 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bear0329

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuxing1-1: 金币+2 2012-04-22 10:43:48
根据你的MARKER亮度来看的话,扩增的应该还可以的,是不是胶的问题或者是成像系统没有调好
以马内利!
7楼2012-04-21 23:35:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

cheng_xiao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuxing1-1: 金币+2, 有帮助 2012-04-19 15:57:52
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-20 13:37:09
这样说的话应该是电泳槽的问题,有的时候电泳槽会很热,这时候你电泳电压过高的话就会造成条带不齐,在一个就是胶的浓度,你可以提高一下胶的浓度试一下
我努力我奋斗我成功
2楼2012-04-19 15:56:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxing1-1

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cheng_xiao at 2012-04-19 15:56:30:
这样说的话应该是电泳槽的问题,有的时候电泳槽会很热,这时候你电泳电压过高的话就会造成条带不齐,在一个就是胶的浓度,你可以提高一下胶的浓度试一下

我用过1.5%和2%的琼脂糖凝胶,但是效果都不行
3楼2012-04-19 15:58:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

to-be

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuxing1-1: 金币+2 2012-04-20 08:18:03
其实这个亮度还可以,不排除胶做的太厚,可以多然一段时间啊,号不排除凝胶成像系统的牌照问题哦~
生活是面镜子~
4楼2012-04-19 18:23:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jingquan

铜虫 (正式写手)

照相系统来回调整一下,焦距,曝光时间,等。
marker的750bp亮度都显出差异了,那就是你照相还有一点要摸索。
5楼2012-04-19 20:05:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxing1-1

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by to-be at 2012-04-19 18:23:30:
其实这个亮度还可以,不排除胶做的太厚,可以多然一段时间啊,号不排除凝胶成像系统的牌照问题哦~

染色最长染过半小时,还不理想
6楼2012-04-20 08:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxing1-1

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by bear0329 at 2012-04-21 23:35:46:
根据你的MARKER亮度来看的话,扩增的应该还可以的,是不是胶的问题或者是成像系统没有调好

不知道啊
换个marker试试看
8楼2012-04-22 10:44:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaoyl0679

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
土壤基因组提的不好,导致扩增效果较差
9楼2012-04-22 16:33:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxing1-1

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by yaoyl0679 at 2012-04-22 16:33:31:
土壤基因组提的不好,导致扩增效果较差

检测过,纯度和含量都行
10楼2012-04-22 17:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuxing1-1 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
请填处理意见