24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3926  |  回复: 15

小周

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 重叠延伸PCR引物合成求助

最近想把两个DNA片段连起来,想用SOE PCR的方法,看了半天引物设计时都没有搞明白。
假设我的片段A序列为:5’CGA GGATCCAG CATG GAG ACA GAC ACA CTC CTG CTA TGG GTA CTG ........ ACT GGT GACCAT CAT CAC CAT CAC CAT3’

B片段的序列为:5’GACGATGACGACAAGccagtaccccc................agggctcttcggcaaatgtaaGTCGACCAGG3’

希望的结果为A在前B在后:
5’CGA GGATCCAG CATG GAG ACA GAC ACA CTC CTG CTA TGG GTA CTG ........ ACT GGT GACCAT CAT CAC CAT CACCATGACGATGACGACAAGccagtaccccc................agggctcttcggcaaatgtaaGTCGACCAGG3’
中间两条引物该怎样设计呢?谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lvbobo823

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
telomerase: 金币+1, 谢谢你的热心应助 2012-03-24 20:36:38
小周: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-26 17:08:10
就是搭桥PCR。设计引物时A片段3‘端取20bp左右的碱基,B片段5’端取20个碱基左右,总碱基不要超过50bp(大于50公司合成会比较贵),同时合成该引物反向互补片段。
用这条引物跟B片段的反向引物扩增B片段。再用这条引物反向互补序列为反向引物与A片段的正向引物扩增A片段。
把上一步扩增的A,B产物等摩尔混合再用A片段的正向引物与B片段的反向引物扩增,跑胶,回收你需要的大小的片段。
hehe
5楼2012-03-24 16:16:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tyw2623

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

overlapPCR

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 新建 Microsoft Office Word 文档.docx
  • 2012-03-25 21:18:04, 13.34 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

水遁
9楼2012-03-25 21:18:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

颜英

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小周: 金币+2, 有帮助 2012-03-26 17:07:52
引物的设计不是有软件吗?我的实验也需要设计引物,师姐推荐我用primer premier5这个软件,因为我的目的基因还没确定,所以这个软件我还没用过,不知好不好用呵呵。。。
2楼2012-03-24 13:17:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小周

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
2楼: Originally posted by 颜英 at 2012-03-24 13:17:14:
引物的设计不是有软件吗?我的实验也需要设计引物,师姐推荐我用primer premier5这个软件,因为我的目的基因还没确定,所以这个软件我还没用过,不知好不好用呵呵。。。

这个我知道,呵呵。连接片段稍微麻烦点。
3楼2012-03-24 14:57:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imyting

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小周: 金币+3, 有帮助, 网上的例子也看了,我大概也知道应该是样子,脑子有点笨,具体怎么设计想不明白。 2012-03-24 15:40:45
取A序列的末端20个和B序列的前端20个,分别与A和B进行PCR,再回收产物做模板进行第二次PCR。我只是举个例子,具体的引物你还得仔细分析一下。
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
4楼2012-03-24 15:14:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinpeng_6118

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小周: 金币+5, 有帮助 2012-03-26 17:08:23
就是说A片段的下游与B片段的上游交接处重叠30-40个碱基就行了。A片段的下游引物稍微再往B方向延伸一些,而B片段的上游引物往A方向延伸些,他们就能重复出一段重叠区域。
人生百态原为海,看破红尘方为岸!
6楼2012-03-25 10:27:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

to-be

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小周: 金币+5, 有帮助 2012-03-26 17:08:32
1.设计2对引物,A5‘ &3’ ;B5‘&3’;A3‘和B5’ 引物有大于15bp的overlap。
2. 分别扩增A和B;
3.A和BPCR 产物等摩尔比混合,共同做模板,用A5‘和B3’扩增。
4.如果扩增效果不好,可以将A5‘和B3’ 向中间移动20左右bp重新设计引物扩增。

可以查看Overlap extension PCR
生活是面镜子~
7楼2012-03-25 14:58:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物一点点

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有需要的话可以把具体序列发过来,给你设计 了试试哦

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2012-03-25 19:22:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小周

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by 生物一点点 at 2012-03-25 19:22:06:
有需要的话可以把具体序列发过来,给你设计 了试试哦

谢谢啦
10楼2012-03-26 17:11:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小周 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-31 5/250 2026-03-31 23:08 by liu823948201
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +4 小叮当来了 2026-03-30 4/200 2026-03-31 16:48 by shengliu165
[考研] 085601 材料工程 313分 求调剂 +6 Ong3 2026-03-27 6/300 2026-03-31 15:18 by yanflower7133
[考研] 土木304求调剂 +3 顶级擦擦 2026-03-31 3/150 2026-03-31 13:59 by 西京学院招办
[考研] 266分,求材料冶金能源化工等调剂 +8 哇呼哼呼哼 2026-03-27 10/500 2026-03-31 13:35 by Huaxue_Wang
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 085600,专业课化工原理,320分求调剂 +6 大馋小子 2026-03-29 6/300 2026-03-31 10:03 by 氯化亚硝酰
[考研] 福建理工大学材料学院先进合金团队招收考研调剂学生 +3 大华金商都 2026-03-30 4/200 2026-03-31 01:04 by 方英俊602
[考研] 359求调剂 +5 王了个楠 2026-03-25 5/250 2026-03-30 19:36 by 源_2020
[考研] 297求调剂 +17 田洪有 2026-03-26 18/900 2026-03-30 18:32 by nothing投稿中
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 342求调剂 +4 加油a李zs 2026-03-26 4/200 2026-03-30 16:39 by 晶体之美
[考研] 085701求调剂初试286分 +5 secret0328 2026-03-28 5/250 2026-03-30 12:54 by fangnagu
[考研] 070305高分子化学与物理 304分求调剂 +12 c297914 2026-03-28 12/600 2026-03-29 16:21 by Serene1974
[考研] 0856,材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 材料求调剂 +5 .m.. 2026-03-25 5/250 2026-03-27 11:08 by 不吃魚的貓
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
信息提示
请填处理意见