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feiye2214

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】PCR--小弟上图了,帮我看看图 已有17人参与


这是我用其他物种唐鱼、鲤鱼的目的基因片段的引物去扩乌贼的这个目的片段,出现了很多条带(还有很多的相关引物正在做,先做的这两条),目的片段是b-actin,应该还算保守吧?
图:上面是唐鱼,下面是鲤鱼
从左至右是45-65度的退火温度梯度
本人觉得是引物特异性不高,因为前面45度时条带很多,到后面的65度又没有条带出现。
高手帮我出出主意,怎么能增加特异性扩增?

[ Last edited by feiye2214 on 2010-12-9 at 21:52 ]
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+3):谢谢交流!:tiger06: 2010-12-09 23:26:32
引用回帖:
Originally posted by feiye2214 at 2010-12-09 23:02:38:

touchdownPCR原理算是明白了,但是实验室没有人做过这个,一般的PCR就可以做吗?

能做梯度的那种PCR仪程序设置起来很方便,每个循环升一点。不能这样设置的就得设置N次了。东盛 龙 的那个叫黑金刚的用起来还是很不错的。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
8楼2010-12-09 23:08:40
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1): 2010-12-28 14:04:20
乍一看还以为是筛ssr呢    引物特异性太低,重设计吧
2楼2010-12-09 22:20:59
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引物特异性太差,另外可以试试touchdownPCR。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2010-12-09 22:27:56
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by feiye2214 at 2010-12-09 21:27:31:
[img]这是我用其他物种唐鱼、鲤鱼的目的基因片段的引物去扩乌贼的这个目的片段,出现了很多条带(还有很多的相关引物正在做,先做的这两条),目的片段是 ...

很漂亮的说,请问你是什么marker,多大的胶?
小木虫之有关部门负责人
4楼2010-12-09 22:32:15
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