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schengxi

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助!!!关于内参基因的选择问题。 已有6人参与

我的试验是要做一个物种的一些基因,得到全长后,要进一步做RNAi和实时荧光PCR等。

可是我的这个物种没有相关的actin,能找到的只有ITS,28S之类的基因。

可是我的试验是要用cDNA做模板的,我听师姐说,ITS和28S只能用在DNA上。

所以现在很烦恼,我不太懂,也不知道接下来该怎样试验,希望各位高手指点一下。不胜感激!
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muchongchong838

禁虫 (正式写手)

schengxi(金币+1):我好像只能找到ITS和28S。如果可以找到很多18s,是不是就比对后设计引物? 2010-07-22 16:20:56
本帖内容被屏蔽

2楼2010-07-22 10:21:57
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看天

木虫 (知名作家)

1949stone:好勤奋 2010-07-22 12:30:53
不知道 不懂 帮顶
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
3楼2010-07-22 12:24:17
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sunyongle1

木虫 (正式写手)

schengxi(金币+1):好的。我去找找18s的。这样的cDNA反转录可以用oligdt吗? 2010-07-22 16:22:33
只要是看家基因,而且RNAi的基因的变化不会影响参照基因的变化就可以了。比如18s rRNA, rbcs2,相关基因都可以。不过首选18s
4楼2010-07-22 13:53:39
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muchongchong838

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2010-07-22 17:47:02
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主

schengxi(金币+1): 2010-09-29 21:54:11
这种内参没有内含子,要防止基因组污染,不太容易
6楼2010-07-22 18:07:50
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won7

金虫 (小有名气)

同意silicare 的看法,并且除了要考虑基因组DNA外,要用18S作内参,反转录时只能用随机引物。
7楼2010-07-22 18:31:42
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ronghuan

银虫 (小有名气)

可以直接提RNA,做反转录,得到cDNA,引物可以用olig
8楼2010-07-22 20:12:42
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