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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求助！！！关于内参基因的选择问题。
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schengxi

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助！！！关于内参基因的选择问题。 已有6人参与

我的试验是要做一个物种的一些基因，得到全长后，要进一步做RNAi和实时荧光PCR等。

可是我的这个物种没有相关的actin，能找到的只有ITS，28S之类的基因。

可是我的试验是要用cDNA做模板的，我听师姐说，ITS和28S只能用在DNA上。

所以现在很烦恼，我不太懂，也不知道接下来该怎样试验，希望各位高手指点一下。不胜感激！
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1楼 2010-07-22 10:11:42
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muchongchong838

禁虫 (正式写手)
schengxi(金币+1):我好像只能找到ITS和28S。如果可以找到很多18s，是不是就比对后设计引物？ 2010-07-22 16:20:56
本帖内容被屏蔽
2楼2010-07-22 10:21:57
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看天

木虫 (知名作家)
1949stone:好勤奋 2010-07-22 12:30:53
不知道 不懂 帮顶
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
3楼2010-07-22 12:24:17
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sunyongle1

木虫 (正式写手)
schengxi(金币+1):好的。我去找找18s的。这样的cDNA反转录可以用oligdt吗？ 2010-07-22 16:22:33
只要是看家基因，而且RNAi的基因的变化不会影响参照基因的变化就可以了。比如18s rRNA, rbcs2，相关基因都可以。不过首选18s
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4楼2010-07-22 13:53:39
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muchongchong838

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
5楼2010-07-22 17:47:02
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silicare

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合伙创业版兼职版主

优秀版主
schengxi(金币+1): 2010-09-29 21:54:11
这种内参没有内含子，要防止基因组污染，不太容易
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6楼2010-07-22 18:07:50
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won7

金虫 (小有名气)
同意silicare 的看法，并且除了要考虑基因组DNA外，要用18S作内参，反转录时只能用随机引物。
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7楼2010-07-22 18:31:42
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ronghuan

银虫 (小有名气)
可以直接提RNA，做反转录，得到cDNA，引物可以用olig
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8楼2010-07-22 20:12:42
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