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z45858502

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 辣椒的内参基因

谁知道辣椒的内参基因，用于荧光定量PCR用的。mrna序列或者引物序列啊

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sjyinlong

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1楼2011-07-23 23:17:01

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barrey

铁虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
adslye(金币+3): 不错是这理~鼓励交流~祝顺利！ 2011-08-04 08:51:24
silicare(BioEPI+1): 2011-08-04 11:57:01
z45858502(金币+1): 谢谢了 2011-08-06 08:07:02

这个，现在内参基因标准不一，植物中普遍应用的内参基因主要有Actin、Ubiqutin、EF1a等，至于序列嘛，应该很多参考文献都有列出的，上述提到的内参基因也不是绝对，最近几年在好几个物种中就有报道，这些基因在不同的生物和非生物胁迫条件表达水平完全趋于不变，需要具体情况具体分析。

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2楼2011-08-03 17:52:07

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adslye

银虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
silicare(金币+3, BioEPI+1): 2011-08-04 11:56:50
z45858502(金币+1): 谢谢。不过这些方法我都知道 2011-08-06 08:06:49
z45858502(金币+1): 回答太笼统了 2011-08-10 13:30:56
z45858502(金币+2): 2011-08-12 08:33:04

1.你可以去genbank搜：18S,28S,40S,Elongation factor,Eukaryotic initiation factor,ACTIN,Beta-tubulin, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, Cyclophilin,Polyubiquitin等以上关键词。（以上关键词来自于这些文章BMC Plant Biol ，Jana Jarošová，2010 。Mallona et al. BMC Plant Biology 2010, 10:4 。BMC Plant Biology 2009, 9:84 。Érica Duarte Silveira 1 Huis et al. BMC Plant Biology 2010, 10:71）
2.推荐你去BMC PLANT,和BMC Molecular Biology这个杂志找找，登了很多物种内参选择的文章。看有没有你的物种你条件下的内参。
你如果时间充裕的话，建议自己筛内参（当然在没有内参稳定性研究报道的前提下）。毕竟每种诱导条件下，或者生长条件下，内参是否稳定是不确定的。
vandesompele, J. (2002). "Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes." Genome Biology （上面那个结论就是这篇文章的研究，被引用了3000多次）

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3楼2011-08-04 09:03:32

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