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能养鱼的猫

新虫 (小有名气)

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[交流] 菌株系统树的构建

本人现在在做菌株的系统发育树，根据菌株的16srDNA做的，总是做不好，跪求大神指点

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1楼 2017-03-14 19:27:46

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博学必多才A

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by 416114799 at 2017-03-21 19:32:24
① 做进化树，不是全部都选很接近的菌，这样做出来的树不如说是相似树好了，而非进化树，进化树要大概看出来一个进化关系，所以亲远的都得选，亲远选择是第一步；② 从100%一直到90%左右，每个属挑几个，这样就在进 ...

因为本科不是生物方面的，做的是筛菌，筛功能菌，对于菌的种属情况不了解，只能在NCBI比对之后做系统发育树来确定，是不是就得在比对出来的菌里面挑选来做。还有就是我找到比较相关的菌株，但是给出的结果只是到纲，没有太看明白，找到那篇文章，他的菌也是筛的，但是他怎么知道是哪个菌属的呢？我想根据他的来确定，看看我该怎么做系统发育树