| 查看: 3433 | 回复: 10 | ||
| 本帖产生 1 个 MicEPI ，点击这里进行查看 | ||
太行山1986银虫 (小有名气)
|
[求助]
一个菌株和最高同源性的菌，构建系统发育树两个菌不在一起 已有1人参与
|
|
| 一个菌株和最高同源性的菌，构建系统发育树两个菌不在一起，而是和其他同源性低点的菌株在一起，我的问题是这是什么原因？若要鉴定该菌株要和哪个一起实验才合理？ |
回复此楼» 猜你喜欢
314求调剂
已经有8人回复
-
08工科 320总分 求调剂
已经有5人回复
-
085601专硕，总分342求调剂，地区不限
已经有5人回复
-
085600材料与化工调剂 324分
已经有4人回复
-
311求调剂
已经有6人回复
-
化工学硕306求调剂
已经有10人回复
-
286求调剂
已经有8人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有9人回复
-
311求调剂
已经有12人回复
-
271材料工程求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何通过16SrDNA鉴定菌种
已经有16人回复
- 霉菌18SrDNA鉴定，构建发育树的问题
已经有6人回复
- 建立系统发育树
已经有10人回复
- 这样还有必要建系统发育树吗？
已经有10人回复
- 【Journal Club】第3讲 水稻全基因组基因网络生物信息学平台的建立
已经有33人回复
- 系统发育树如何分析，得出结论？
已经有13人回复
- 请问构建系统发育树 比对菌株的选择原则
已经有3人回复
- 基于氨基酸的系统发育树的构建
已经有6人回复
- 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊？送金币
已经有34人回复
- 关于生物进化发育树之类的分析
已经有9人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 同源性与进化树的矛盾
已经有24人回复
- 真菌种属鉴定 系统发育树构建
已经有5人回复
- 【求助/交流】最大似然法构建系统发育树
已经有3人回复
- 【求助/交流】如何构建系统更发育树
已经有16人回复
- 【求助/交流】关于系统发育树，如何鉴定菌种
已经有12人回复
- 微生物学考研资料1(沈萍版同步）免币分享
已经有67人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
laozuzunzhe: MicEPI+1, good! 2013-07-07 13:14:46
太行山1986: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-09 11:03:56
laozuzunzhe: MicEPI+1, good! 2013-07-07 13:14:46
太行山1986: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-09 11:03:56
|
① Identification≠构树时可信度也高，构建进化树时是否在同一簇除了与同源性高低有关外，序列之间同源的可信度高低也很大关系的；比如a和b碱基15不一样，a和c28不一样，结果是不一样的； ② 进化树是判断进化地位的图谱，体现出来的是进化距离。你选的那些序列跟你的序列放一起构建进化树，如果彼此之间刚好就缺了某一个很关键的“中间型”种，你没拿进来，可能就不成簇了； ③ 构建进化树选择序列，最好是同一个属不同种的都挑一个，最多2-3个，要反复挑选，选出最好的那一个。如果你要构建更大的树，比如涉及到不同的科或者其他，可能选择序列又要考虑更多了，反正选择序列是体力活； ④ 现在NCBI提交的很多序列，都是不完整、不准确的，说不定测序错误，甚至也难保有测序公司给你瞎搞吧？现在的NCBI数据库很乱的，里面有个专家库，里面的东西就比较科学、准确。 综上，很多因素哈！做个比较适当的树就行了。 |
10楼2013-07-07 07:59:36
2楼2013-07-04 08:06:44
见神一笑
木虫 (著名写手)
- 应助: 39 (小学生)
- 金币: 4301.8
- 散金: 2000
- 红花: 6
- 帖子: 1083
- 在线: 118.3小时
- 虫号: 648935
- 注册: 2008-11-08
- 专业: 生物信息学
6楼2013-07-05 07:35:54
见神一笑
木虫 (著名写手)
- 应助: 39 (小学生)
- 金币: 4301.8
- 散金: 2000
- 红花: 6
- 帖子: 1083
- 在线: 118.3小时
- 虫号: 648935
- 注册: 2008-11-08
- 专业: 生物信息学
3楼2013-07-04 16:16:58
4楼2013-07-04 21:09:23
wxldynasty
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 15250.8
- 红花: 1
- 帖子: 1282
- 在线: 132.1小时
- 虫号: 773310
- 注册: 2009-05-18
- 性别: GG
- 专业: 水产生物免疫学与病害控制
5楼2013-07-05 06:59:30
太行山1986
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 84.3
- 散金: 10
- 帖子: 65
- 在线: 10小时
- 虫号: 1720079
- 注册: 2012-03-27
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
7楼2013-07-05 16:09:50
见神一笑
木虫 (著名写手)
- 应助: 39 (小学生)
- 金币: 4301.8
- 散金: 2000
- 红花: 6
- 帖子: 1083
- 在线: 118.3小时
- 虫号: 648935
- 注册: 2008-11-08
- 专业: 生物信息学
8楼2013-07-06 09:51:03
rayn27
新虫 (初入文坛)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1742.5
- 帖子: 21
- 在线: 1011.3小时
- 虫号: 1713456
- 注册: 2012-03-24
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
9楼2013-07-06 11:46:30
