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zhymhbu木虫 (正式写手)
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请问构建系统发育树 比对菌株的选择原则
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分离得到的菌16S测序后，用NCBI的blast比对。99%相似度的就有几十个。而且都是同一个种的菌株。请问两个问题： 1 如果构建系统发育树，如何选择具体菌株进行建树。有人说过查LPSN。用模式株比对。是这样吗。我看国内微生物学报和通报上也不都是这样。有什么原则吗 2 发育树的各个分支，如何选择。比如我的菌应该是地衣芽孢杆菌，那么我建树是选择芽孢杆菌属的相似度高的菌株吗，还需要选择其他属的细菌建树吗 困惑了很久的问题，请高手赐教呀 |
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