| 查看: 1267 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
菌株系统树的构建
|
|||
|
本人现在在做菌株的系统发育树,根据菌株的16srDNA做的,总是做不好,跪求大神指点 发自小木虫Android客户端 |
» 猜你喜欢
球磨粉体时遇到了大的问题,请指教!
已经有9人回复
江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
求助细菌系统发育树构建时参比菌株的选择
已经有0人回复
系统发育树拓扑结构分析
已经有0人回复
建系统发育树怎么弄数值?(树节点上的那些数值)
已经有3人回复
怎样用EzTaxon构建系统发育树啊???
已经有1人回复
向高人请教,关于构建系统发育树的,谢谢!
已经有12人回复
求教关于使用16s RDNA对细菌鉴定时,关于构建系统发育树的问题。
已经有12人回复
系统树如何分析
已经有9人回复
求大神帮助小弟构建一下这个菌株序列的进化树
已经有5人回复
系统发育树中比对序列怎么选的??在哪里选。。
已经有2人回复
mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题
已经有6人回复
构建酵母系统发育树问题-急,请大侠给予帮助
已经有6人回复
一株霉菌的系统发育树构建
已经有4人回复
一株盐单胞菌,blast结果和系统发育树的构建不一致啊,这是怎么回事?
已经有7人回复
系统发育树构建中的若干问题
已经有14人回复
真菌系统发育树建立
已经有1人回复
一个菌株和最高同源性的菌,构建系统发育树两个菌不在一起
已经有10人回复
系统发育树构建求教
已经有4人回复
如何从NCBI上下载菌株的16S rDNA序列,请问在NCBI上如何下载?
已经有5人回复
请问构建系统发育树 比对菌株的选择原则
已经有3人回复
做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法!!
已经有18人回复
Val23
银虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 255.4
- 散金: 68
- 帖子: 163
- 在线: 28.5小时
- 虫号: 2925437
- 注册: 2014-01-10
- 性别: MM
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
3楼2017-03-20 16:56:38
2楼2017-03-20 16:22:53
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
序列选得不好,根据你的菌的大体的分类地位序列,不能简单地根据相似度选,例如,你的菌具体属于哪个科?哪个属?结合这个科,这个属内的一些菌的序列,以及16s相似度斤的序列来做发育树 发自小木虫Android客户端 |
4楼2017-03-20 17:15:40
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
|
首先纠正下是16S rRNA,此外,进化树不是根据NCBI数据库序列相似性来选,而是同属不同种都选1-2个,选到相似性90出头的就不要了。 发自小木虫Android客户端 |

5楼2017-03-21 10:01:05













回复此楼