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y383514131

银虫 (小有名气)

[求助] 菌落pcr该怎么做 已有25人参与

最近做菌落pcr总是做不出来,而提基因组或提质粒后再进行pcr都是可以p出来的,求做菌落pcr注意事项,细节,个人经验等

@youlinglyw 发自小木虫IOS客户端
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此事说来终觉浅,莫问出处便是真
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zgs_2013

银虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 22:56:45
挑菌落时选平皿上的单菌落,非常小的刚长出的那种,用无菌枪头刮下,放到10微升的无菌水搅拌,外观看起来稍微有点混浊。然后pcr时20微体系模板加1~5微就够了

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10楼2016-11-16 13:04:00
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xiaominzheng

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-23 22:03:39
看大家好多都是用的枪头挑菌,小建议:用牙签的尖尖沾一下确定碰着菌就好,然后抖两下就可以了。

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38楼2016-11-22 22:31:09
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hubeigxkkk

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 22:57:44
说下个人经验。首先挑菌一定要找圆润的单菌落,用10ul枪头略微碰到菌落就可以(不能沾太多菌体),然后将枪头在PCR体系吹打几次。PCR程序我得预变性是94℃,5min。
23楼2016-11-17 17:33:59
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siyuansing

银虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 23:00:20
我都是挑菌到400ul的LB里,取1ul当做模板进行PCR,剩下的在37度培养。菌液PCR能做出来的再在试管培养,保种测序。菌液PCR能做出来的都有,做不出来的都没有。

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36楼2016-11-20 22:07:42
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wangxiao318

银虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 22:58:19
如果是平板,挑菌时沾一点就行,不要以肉眼看到作标准,预变性时间稍长些,以你的菌种类型来定。如果是摇的菌液,最好是取新鲜的,生长状态最好时的,1微升足矣。另外,实验时加上对照,阴性的,阳性的,便于排查。

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26楼2016-11-18 08:15:56
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:22:42
xn8008: 应助指数+1 2017-01-12 08:22:55
挑菌的时候挑少点,不要太多,否则p出来

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···
2楼2016-11-16 08:47:55
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孙丹7780

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 22:56:24
挑菌使用镊子夹取10ul枪头挑菌 在配好体系的pcr管中沾1-2下即可
会不会是挑菌抠到太多培养基 实际上菌落并没有接触到管中的液体,你的pcr没有模板所以扩不出来

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3楼2016-11-16 09:02:17
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y383514131

银虫 (小有名气)


送红花一朵
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:22:33
引用回帖:
15楼: Originally posted by ULYSSEESWB at 2016-11-17 08:04:14
菌有点就行,如果pcr体系肉眼看都浑浊就明显过量了,另外
95预变性至少5min以上吧...

我也在验证菌落量的问题,今天可以看结果了

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此事说来终觉浅,莫问出处便是真
16楼2016-11-17 08:19:33
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上官凤舞

新虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-23 22:04:08
阳性菌的话,需要破壁,加溶菌酶作用,或者反复沸水煮冰上冻,最后离心即可

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18楼2016-11-17 08:49:37
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hattie919822

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-11-20 22:57:09
一般我都是在超净工作台里面,用10微升的墙头将菌落挑进去10微升的无菌水里面,混匀,肉眼可看见稍微浑浊,然后取1微升作为模板。
不见不知不伴不惜不
32楼2016-11-18 16:52:52
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鱼》

新虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:23:37
不要浓度过高,不然不容易p

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33楼2016-11-18 17:10:24
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remain2018

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:23:48
引用回帖:
1楼: Originally posted by y383514131 at 2016-11-16 08:38:01
最近做菌落pcr总是做不出来,而提基因组或提质粒后再进行pcr都是可以p出来的,求做菌落pcr注意事项,细节,个人经验等
youlinglyw

挑单菌落,一点就够。然后pcr时20微体系模板加1微升,实在P不出来,用特异性引物试试

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64楼2016-11-30 19:48:48
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wenwanhong

新虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:24:22
菌落pcr,我一般都是用小枪头粘一小坨用枪吹打入预混液当中,在pcr仪上99℃10min破菌,然后再加taq酶进行pcr,屡试不爽试一下吧,预祝成功

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81楼2016-12-21 16:37:41
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缘来是伊

木虫 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:24:29
这个得看你的菌种,如果是大肠的话很容易的,如果是其他尤其是阳性菌的话需要裂解液裂解一下再做

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88楼2016-12-30 18:49:49
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a13515517892

木虫 (小有名气)

感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 应助指数-2 2017-01-12 08:23:25
这个你先要把自己的实验过程大致写一下,看看是不是有问题,完全的照搬别人的方法不一定适用啊
5楼2016-11-16 10:56:06
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-01-12 08:24:08
挑菌落到100 μl培养基,培养几个小时,取培养液PCR
65楼2016-12-01 16:34:24
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普通回帖

佳敏佳敏

新虫 (初入文坛)

菌不宜太多

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4楼2016-11-16 09:15:27
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y383514131

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by a13515517892 at 2016-11-16 10:56:06
这个你先要把自己的实验过程大致写一下,看看是不是有问题,完全的照搬别人的方法不一定适用啊

我做的时候一般都会挑很多菌进去,整个体系都会变浑浊

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6楼2016-11-16 12:39:17
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y383514131

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 佳敏佳敏 at 2016-11-16 09:15:27
菌不宜太多

怎么确定多还是不多,我现在就怀疑我挑的是不是太多

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7楼2016-11-16 12:40:06
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y383514131

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引用回帖:
2楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-16 08:47:55
挑菌的时候挑少点,不要太多,否则p出来

怎么确定量的多少?我确实挑的非常多

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8楼2016-11-16 12:40:50
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y383514131

银虫 (小有名气)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by 孙丹7780 at 2016-11-16 09:02:17
挑菌使用镊子夹取10ul枪头挑菌 在配好体系的pcr管中沾1-2下即可
会不会是挑菌抠到太多培养基 实际上菌落并没有接触到管中的液体,你的pcr没有模板所以扩不出来
...

菌太多,培养基应该没有。可以把你的菌落pcr具体步骤借我看看

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9楼2016-11-16 12:42:36
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