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陈硕

铜虫 (正式写手)

[求助] 双酶切为什么会切出来这么多条带? 已有3人参与

我是对质粒进行双酶切,用的是BamH I 和EcoR V这两个酶,采用20微升酶切体系。Marker 是15000的,四个样的双酶切目的条带在1650bp左右的位置,最右侧的一个是对照,对照质粒酶切下来的条带是400bp左右。为什么我得到的重组质粒双酶切会出现这么多条带的情况?该如何避免?单酶切一切正常。第二个图是单酶切。

双酶切为什么会切出来这么多条带?
双酶切1o 2016-03-10 21 时 05 分.jpg


双酶切为什么会切出来这么多条带?-1
EcoRV单酶切条带 5号112016-03-10 18 时 46 分.jpg
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anjingde

铜虫 (小有名气)

BamH I 和EcoR V这两个酶的单酶切都是要做的,如果两个结果相差很大,可能是载体或者重组的基因里有其中一个酶的酶切位点

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5楼2016-03-11 08:56:51
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陈硕

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wang2568 at 2016-03-11 08:44:35
切成marker了,啥质粒这么牛!

我们实验室自己重建的质粒。感觉我后期再加工加工可以做marker当商品卖了,到时候给你五折优惠,哈哈。我也不知道为啥,出发质粒好好的,要说双酶切咋会这么多长度区间都有条带呢?想不通,找不到原因。

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10楼2016-03-11 17:56:28
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寻塔dadada

新虫 (初入文坛)

会不会和你抽的质粒有关系啊,我们实验室之前就有同学抽质粒出现问题,双酶切时就出现好几条杂条带。后来重新抽了质粒再去双酶切就好了。

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14楼2016-03-12 00:22:54
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gmingwei102

新虫 (初入文坛)

如果担心你的酶切位点有问题,你可以在质粒那个酶切位点设计一个引物,将质粒拿去用引物测个序,就知道位点有没有问题了

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

17楼2016-03-12 15:31:31
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hawkinghj

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
陈硕: 金币+5 2016-03-14 10:37:15
把空质粒和目标基因分别进行单酶切,逐步排除问题嘛!
这么多条带你不会是把marker,和buffer弄混了吧?

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18楼2016-03-13 11:17:25
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普通回帖

生科深似海

新虫 (小有名气)

先把质粒送去测序吧

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2楼2016-03-10 22:06:17
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岁月静好12

铁虫 (小有名气)

还有相同的酶切位点

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怒放的生命
3楼2016-03-10 22:28:27
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wang2568

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
陈硕: 金币+5 2016-03-14 10:33:50
切成marker了,啥质粒这么牛!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-03-11 08:44:35
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ken19860823

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
陈硕: 金币+20 2016-03-14 10:34:20
你连接片段进去的时候是用的哪两个酶(或者哪一个酶)进去的,用的也是这两个酶么(BamHI 跟EcoRV)?
做基因修饰的老菜鸡
6楼2016-03-11 09:28:57
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陈硕

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ken19860823 at 2016-03-11 09:28:57
你连接片段进去的时候是用的哪两个酶(或者哪一个酶)进去的,用的也是这两个酶么(BamHI 跟EcoRV)?

也是用这两个酶。好纠结啊,BamH I之前酶切不成功,感觉像是这个酶切位点出了问题。让我不明白的是就算那个位点出问题,那该怎么解释双酶切时出来这么多条带。这两天快被整疯了,想不明白。

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7楼2016-03-11 14:53:17
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陈硕

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by anjingde at 2016-03-11 08:56:51
BamH I 和EcoR V这两个酶的单酶切都是要做的,如果两个结果相差很大,可能是载体或者重组的基因里有其中一个酶的酶切位点

我今天再做一遍BamH I 的单酶切看看。

发自小木虫Android客户端
8楼2016-03-11 14:54:28
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ken19860823

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 陈硕 at 2016-03-11 14:53:17
也是用这两个酶。好纠结啊,BamH I之前酶切不成功,感觉像是这个酶切位点出了问题。让我不明白的是就算那个位点出问题,那该怎么解释双酶切时出来这么多条带。这两天快被整疯了,想不明白。
...

大兄弟,你没发现EcoRV是平末端酶么?换一个其他的酶吧。
做基因修饰的老菜鸡
9楼2016-03-11 15:45:45
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