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求助NAMD做动力学遇到的问题
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*.xyz文件import无法进行咋回事
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zergstormor
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zergstormor
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LAMMPS/
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[已完结]
lammps并行打开mpi失败
(2/1026)
zura
2012-04-05
2012-04-05 09:20:33
by
zura
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专家会诊
]
[已完结]
如何计算蛋白质相互作用面上的各种作用力
(1/701)
md546169161
2012-04-04
2012-04-05 09:03:44
by
loudonghua
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其他
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【求助】高分子自组装
(评阅-3)
(3/1097)
zhh1249
2010-12-08
2012-04-05 08:35:20
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李学忠
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Gromacs
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NAMD+CHARMM力场的模拟能公开发表么
(2/779)
smallhawk
2012-04-04
2012-04-04 20:51:19
by
tiankong303
[
MS
]
[已完结]
用MS构建羟基磷灰石的模型
(3/1637)
aoteman6
2012-04-03
2012-04-04 20:41:30
by
UncleAhead
[
MS
]
[已完结]
用Ms软件切偏矾酸铯晶体的厚度
(0/230)
tomoyaayu
2012-04-04
2012-04-04 09:32:12
by
tomoyaayu
[
MS
]
[已完结]
adsorption locator和sorption
(1/1864)
雨中树下
2012-02-24
2012-04-03 22:12:35
by
alphawei
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助AUTODOCK中怎么移动分子
(4/1853)
muye1001
2012-02-27
2012-04-03 21:14:11
by
longdlut
[
DS/Syby
]
[已完结]
分子对接打多少分有实际意义
(4/4449)
虎虎猪
2012-02-24
2012-04-03 20:57:43
by
longdlut
[
专家会诊
]
[已完结]
求助:linux下运行autodock/docking/docking parameters时出错
(1/655)
茜茜茜茜
2012-03-17
2012-04-03 19:52:09
by
longdlut
[
DS/Syby
]
【求助】linux系统怎么安装拨号上网,怎么在linux安装autodock
(评阅+1)
(7/2620)
xishou
2010-11-30
2012-04-03 17:33:04
by
longdlut
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock配体的键断裂
(2/887)
wqx1990
2011-11-03
2012-04-03 17:23:09
by
longdlut
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DS/Syby
]
[已完结]
autodock rmsd计算偏大
(2/1236)
greatlse
2012-03-24
2012-04-03 15:39:35
by
longytu
[
DS/Syby
]
AUTODOCK中的flexible residues的问题
(模拟EPI+1)
(8/2467)
PSA
2011-08-31
2012-04-03 08:36:32
by
PSA
[
DS/Syby
]
[已完结]
关于AUTODOCK学习后的一些疑惑求解。
(4/1476)
可米kemi
2011-11-29
2012-04-03 04:56:58
by
longytu
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps invilid command-line argument
(3/2519)
liuxun200376
2012-03-28
2012-04-03 04:46:09
by
sdzjc1988
[
MS
]
[已完结]
forcite的restart
(0/566)
tsadaye
2012-04-03
2012-04-03 00:17:18
by
tsadaye
[
Gromacs
]
[已完结]
GROMACS安装时总是出现configure: error: Unknown FFT library,请问是什么原因
(9/3698)
hjun79
2012-03-26
2012-04-02 18:54:46
by
dubo
[
Gromacs
]
求gromacs下QM/MM交作业pbs脚本
(1/1478)
astringent
2012-04-01
2012-04-02 18:53:29
by
dubo
[
DS/Syby
]
关于autodock中使用格子和结果的几个问题。
(2/916)
chengfs
2012-02-11
2012-04-02 17:27:38
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock 4 对接中考虑水分子吗?
(4/1749)
merryapple
2012-02-29
2012-04-02 17:26:25
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
AutoDock新手问题
(3/1403)
wangyan10
2012-03-08
2012-04-02 17:25:01
by
longytu
[
DS/Syby
]
有关autodock发文章的问题
(10/2526)
wuhaigang
2012-02-28
2012-04-02 17:22:08
by
longytu
[
其他
]
[已完结]
[关贴]
为什么算出来的能量是负值?
(3/3638)
t13340033021
2012-04-02
2012-04-02 16:18:39
by
qwerasdf2783
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock使用中的一些问题
(5/2037)
xjwlika
2011-06-16
2012-04-02 16:12:46
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock中ligand的问题
(
1
2
)
(金币≥1)
(15/215)
xjwlika
2011-06-17
2012-04-02 16:12:27
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
怎样设置柔性残基?
(6/2741)
lily_llf
2011-05-19
2012-04-02 16:12:05
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
[b]菜鸟30金币急求Autodoc4.2在winXP下的完全安装教程[/b]
(5/2763)
熔融
2011-05-18
2012-04-02 16:11:30
by
longytu
[
其他
]
[已完结]
怎样知道蛋白质的活性口袋呢?用AutoDock作分子对接时怎样选定柔性残基呢?
(2/3036)
lily_llf
2011-05-18
2012-04-02 16:11:10
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
为什么要进行能量最小化?
(7/5044)
lily_llf
2011-05-21
2012-04-02 16:10:38
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
AutoDock的安装?
(7/3382)
NO.24Kobe
2011-05-23
2012-04-02 16:10:01
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
运行autodock出现如图很有意思的情况
(4/1719)
奕术
2012-01-22
2012-04-02 16:08:53
by
longytu
[
DS/Syby
]
[已完结]
AUTODOCK求助
(4/1029)
muye1001
2011-12-15
2012-04-02 14:29:29
by
longytu
[
Gromacs
]
[已完结]
关于受体的active与inactive状态模拟
(1/419)
lovedi
2012-04-01
2012-04-02 10:30:58
by
syhu_007012
[
DS/Syby
]
[已完结]
帮忙看看审稿意见(有关氢键键能)
(7/2905)
tuwenwuguan
2012-03-30
2012-04-01 16:41:24
by
tuwenwuguan
[
Gromacs
]
[已完结]
输入小分子的不同pose跑动力学,得到不同的平衡构象,请问正常吗
(4/1018)
cfmzxf84
2012-04-01
2012-04-01 16:17:31
by
ferlich
[
MS
]
[已完结]
ERROR: Expected same number of atoms in original scope and copy.
(0/280)
GTF1902
2012-04-01
2012-04-01 13:16:05
by
GTF1902
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
chemoffice画的结构,sybyl不是别
(1/1063)
cfmzxf84
2012-03-30
2012-04-01 11:04:14
by
zhenguo86
[
MS
]
请教各位,分子动力学模拟NVE系统,不对速度进行标度可以吗?
(7/3093)
fannieyang
2012-03-12
2012-04-01 10:48:16
by
zx2456
[
MS
]
[已完结]
怎样进行这个高分子聚合物的模拟?
(0/2260)
wangyiyongwz
2012-04-01
2012-04-01 10:27:34
by
wangyiyongwz
[
MS
]
[已完结]
求本书的答案
(1/327)
zyj8119
2012-04-01
2012-04-01 09:47:35
by
lixiang_0807
[
LAMMPS/
]
[已完结]
LAMMPS官网一直登录不上去,怎么办?
(2/1354)
cxz314
2012-03-31
2012-04-01 02:14:33
by
ohnesie
[
MS
]
[已完结]
SAPO-34 的晶体模型
(1/464)
yg1570
2012-03-29
2012-03-31 22:58:58
by
zyj8119
[
MS
]
[已完结]
unable to save molecular state?
(2/363)
宝珠珠宝
2012-03-31
2012-03-31 18:27:20
by
itsok
[
MS
]
[已完结]
ms使用出问题
(4/956)
江xiao鱼
2012-03-31
2012-03-31 16:17:26
by
aoteman6
[
LAMMPS/
]
哪位帮我分析一下,一个简单程序
(7/1272)
baigang3500
2012-03-23
2012-03-31 16:03:53
by
lovingstudy
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
Discover中怎样用BTCL编程计算两组分子之间的相互作用能
(0/520)
vallen
2012-03-31
2012-03-31 15:43:55
by
vallen
[
其他
]
[已完结]
关于网络培训
(2/479)
chenxin1888
2012-03-30
2012-03-31 14:11:45
by
chenxin1888
[
DS/Syby
]
[已完结]
500金币求助MOE2010的下载链接
(4/1215)
gundnir
2012-03-30
2012-03-31 12:50:07
by
gundnir
[
MS
]
[已完结]
MS 分析数据 Angle distribution, Dihedral angle
(0/1032)
mengsk
2012-03-31
2012-03-31 12:43:19
by
mengsk
[
MS
]
[已完结]
关于漆酶分子结构中4个铜原子的构型,请各位高手帮帮忙啊
(0/931)
kizikulo
2012-03-31
2012-03-31 10:43:51
by
kizikulo
[
MS
]
[已完结]
关于linux下的MS5.5使用Gateway无法进行计算的求助
(4/1278)
xztjhs
2012-03-26
2012-03-30 23:41:14
by
xztjhs
[
专家会诊
]
为什么目前没有实现蛋白与核酸相互作用的分子模拟软件?
(4/1885)
卢圣国
2012-03-29
2012-03-30 19:22:17
by
卢圣国
[
MS
]
[已完结]
请教 分子动力学模拟 氰酸酯树脂的模型
(2/472)
pyy19890619
2012-03-26
2012-03-30 18:55:24
by
itsok
[
Gromacs
]
[已完结]
amber 保存复合物时出错
(3/930)
sunmuer
2012-03-28
2012-03-30 16:50:09
by
sinokang
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
sorption使用的方法
(1/671)
premonkey
2012-03-28
2012-03-30 15:47:23
by
premonkey
[
其他
]
[已完结]
求教 关于在线拉曼光谱分析设备建模
(1/771)
cb40
2012-03-27
2012-03-30 15:30:20
by
leonil
[
其他
]
【求助】这种图是用什么软件画的
(9/2674)
syf0608
2010-05-20
2012-03-30 15:01:34
by
花之无泪
[
DS/Syby
]
[已完结]
MVD新手请教各位大神!
(5/1555)
lai1979
2012-03-07
2012-03-30 11:02:44
by
snow1580
[
专家会诊
]
[已完结]
激发态二氧化氮的辐射光谱
(0/372)
cc198707
2012-03-30
2012-03-30 09:54:20
by
cc198707
[
DS/Syby
]
[已完结]
求模建问题
(2/485)
郝明
2012-03-28
2012-03-30 08:46:51
by
郝明
[
专家会诊
]
[已完结]
金属配位i物,在Dmol3中问题,结构优化等问题?
(0/669)
hth1289
2012-03-29
2012-03-29 23:22:02
by
hth1289
[
MS
]
[已完结]
吸附
(0/425)
雨中树下
2012-03-29
2012-03-29 20:21:04
by
雨中树下
[
MS
]
[已完结]
铁配合物活化分子氧模型
(0/241)
snowbaby13
2012-03-29
2012-03-29 19:57:38
by
snowbaby13
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于lammps模拟结果可视化的问题
(0/697)
smm0528
2012-03-29
2012-03-29 17:50:20
by
smm0528
[
其他
]
被金蛋连砸5次
(评阅+1)
(12/1682)
zxl523
2012-03-27
2012-03-29 15:09:56
by
dengchun14
[
DS/Syby
]
[已完结]
新手求助,如何在DS中做出漂亮的分子与蛋白对接的3D图片?
(1/1067)
ddcook
2012-03-22
2012-03-29 12:54:48
by
xiaolangxin
[
MS
]
[已完结]
做一个模拟的酶与抑制剂结合的三D图
(8/1509)
有机化学2005
2012-03-28
2012-03-29 12:47:20
by
blue_cat
[
Gromacs
]
[已完结]
g_angle
(0/234)
memgr
2012-03-29
2012-03-29 10:53:26
by
memgr
[
LAMMPS/
]
[已完结]
请问想要在一个in文件中读取两个data文件应该如何设置这两个文件
(0/680)
mengwuyu
2012-03-29
2012-03-29 10:22:13
by
mengwuyu
[
Gromacs
]
【求助】请教如何使用GROMACS做PMF?
(8/2754)
shengxiang
2011-03-11
2012-03-29 06:08:05
by
476992939
[
MS
]
弥散材料热导率怎么来模拟,用什么模型???
(1/480)
wxz1983
2012-03-27
2012-03-28 22:54:20
by
丁丁1812
[
MS
]
[已完结]
MS中两个模型间如何复制粘贴?
(0/1192)
wesley67
2012-03-28
2012-03-28 21:47:16
by
wesley67
[
其他
]
[已完结]
求助关于相平衡的一篇文章
(0/311)
shaxijiang
2012-03-28
2012-03-28 21:12:27
by
shaxijiang
[
MS
]
[已完结]
新手求助怎么用MS实现分子振动
(0/613)
揍用力
2012-03-28
2012-03-28 20:58:29
by
揍用力
[
Gromacs
]
[已完结]
把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
(3/2499)
sunmuer
2012-03-06
2012-03-28 16:54:56
by
wangyan10
[
DS/Syby
]
求教对接中的问题
(0/216)
liuxiu841027
2012-03-28
2012-03-28 16:37:49
by
liuxiu841027
[
其他
]
分子模拟表征的是物理相互作用还是化学相互作用?
(模拟EPI+1)
(5/1697)
huanghl2010
2012-03-25
2012-03-28 16:03:48
by
guanzhouxmc
[
资源
]
Molegro Molecular Viewer2下载
(6/1130)
aqiao
2012-03-27
2012-03-28 16:01:32
by
aqiao
[已完结]
Materials Studio中k-points值的设定
(0/1750)
50065003
2012-03-28
2012-03-28 14:41:36
by
50065003
[
MS
]
[已完结]
atom ID .............
(0/270)
zxl523
2012-03-28
2012-03-28 08:47:16
by
zxl523
[
MS
]
[已完结]
关于“溢出”的问题
(6/967)
江xiao鱼
2012-03-19
2012-03-28 08:23:28
by
973489386
[
Gromacs
]
[已完结]
amber 小分子出错
(2/465)
sunmuer
2012-03-16
2012-03-27 19:54:58
by
minbad
[
MS
]
[已完结]
模拟杂质原子对晶体物性影响
(1/379)
zzfphy
2012-03-27
2012-03-27 19:27:40
by
chaizhm
[
专家会诊
]
[关贴]
关于对同源建模后的结构进行动力学再用于对接的效果
(0/495)
cfmzxf84
2012-03-27
2012-03-27 16:59:40
by
cfmzxf84
[
专家会诊
]
[已完结]
用GOLD对接动力学后的蛋白,出现如下错误,请指教,谢谢
(1/372)
cfmzxf84
2012-03-27
2012-03-27 15:53:28
by
cfmzxf84
[
Gromacs
]
[已完结]
g_sas 怎么区别亲疏水可及表面积
(0/522)
xiaoyingw
2012-03-27
2012-03-27 11:13:59
by
xiaoyingw
[
LAMMPS/
]
[已完结]
funcfl势文件的单位问题
(0/439)
rush7
2012-03-27
2012-03-27 11:01:25
by
rush7
[
Gromacs
]
[已完结]
antechamber是不认磷元素的么
(2/686)
xiaoyuanlong
2012-03-18
2012-03-27 10:08:42
by
超人与小木虫
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD新手求助
(0/365)
linlin9
2012-03-26
2012-03-26 15:46:35
by
linlin9
[
MS
]
[已完结]
复合中心 or 陷阱
(0/1428)
xiaoluoj
2012-03-26
2012-03-26 13:13:48
by
xiaoluoj
[
MS
]
[已完结]
想用MS来研究有机反应羟醛缩合的机理,请问哪位高手能给我提供一下类似文献?
(4/1441)
good---apple
2012-03-25
2012-03-26 11:27:21
by
ti_pn
[
MS
]
[已完结]
MS 动力学计算 步数设置
(
1
2
)
(13/2972)
江xiao鱼
2012-03-23
2012-03-26 11:09:06
by
江xiao鱼
[
其他
]
[已完结]
VMD的显示问题
(0/1238)
lmzxcom1
2012-03-26
2012-03-26 10:32:08
by
lmzxcom1
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD-DREIDING
(0/282)
sdwp1233
2012-03-26
2012-03-26 09:17:58
by
sdwp1233
[
MS
]
[已完结]
quasiclassical trajectory 理论做计算投稿
(1/396)
510528246
2012-03-23
2012-03-25 16:51:42
by
arthur45415
[
CPMD/CP
]
[已完结]
[关贴]
动力学模拟出错
(7/1867)
jianying8996
2011-11-18
2012-03-25 06:42:59
by
jianying8996
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