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怎样知道蛋白质的活性口袋呢?用AutoDock作分子对接时怎样选定柔性残基呢?
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为什么要进行能量最小化?
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lily_llf
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AutoDock的安装?
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2011-05-23
2012-04-02 16:10:01
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longytu
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DS/Syby
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[已完结]
[关贴]
运行autodock出现如图很有意思的情况
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奕术
2012-01-22
2012-04-02 16:08:53
by
longytu
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DS/Syby
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[已完结]
AUTODOCK求助
(4/778)
muye1001
2011-12-15
2012-04-02 14:29:29
by
longytu
[
Gromacs
]
[已完结]
关于受体的active与inactive状态模拟
(1/320)
lovedi
2012-04-01
2012-04-02 10:30:58
by
syhu_007012
[
DS/Syby
]
[已完结]
帮忙看看审稿意见(有关氢键键能)
(7/2313)
tuwenwuguan
2012-03-30
2012-04-01 16:41:24
by
tuwenwuguan
[
Gromacs
]
[已完结]
输入小分子的不同pose跑动力学,得到不同的平衡构象,请问正常吗
(4/783)
cfmzxf84
2012-04-01
2012-04-01 16:17:31
by
ferlich
[
MS
]
[已完结]
ERROR: Expected same number of atoms in original scope and copy.
(0/213)
GTF1902
2012-04-01
2012-04-01 13:16:05
by
GTF1902
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
chemoffice画的结构,sybyl不是别
(1/931)
cfmzxf84
2012-03-30
2012-04-01 11:04:14
by
zhenguo86
[
MS
]
请教各位,分子动力学模拟NVE系统,不对速度进行标度可以吗?
(7/2511)
fannieyang
2012-03-12
2012-04-01 10:48:16
by
zx2456
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MS
]
[已完结]
怎样进行这个高分子聚合物的模拟?
(0/2160)
wangyiyongwz
2012-04-01
2012-04-01 10:27:34
by
wangyiyongwz
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MS
]
[已完结]
求本书的答案
(1/239)
zyj8119
2012-04-01
2012-04-01 09:47:35
by
lixiang_0807
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LAMMPS/
]
[已完结]
LAMMPS官网一直登录不上去,怎么办?
(2/1238)
cxz314
2012-03-31
2012-04-01 02:14:33
by
ohnesie
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MS
]
[已完结]
SAPO-34 的晶体模型
(1/374)
yg1570
2012-03-29
2012-03-31 22:58:58
by
zyj8119
[
MS
]
[已完结]
unable to save molecular state?
(2/266)
宝珠珠宝
2012-03-31
2012-03-31 18:27:20
by
itsok
[
MS
]
[已完结]
ms使用出问题
(4/722)
江xiao鱼
2012-03-31
2012-03-31 16:17:26
by
aoteman6
[
LAMMPS/
]
哪位帮我分析一下,一个简单程序
(7/1004)
baigang3500
2012-03-23
2012-03-31 16:03:53
by
lovingstudy
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
Discover中怎样用BTCL编程计算两组分子之间的相互作用能
(0/449)
vallen
2012-03-31
2012-03-31 15:43:55
by
vallen
[
其他
]
[已完结]
关于网络培训
(2/374)
chenxin1888
2012-03-30
2012-03-31 14:11:45
by
chenxin1888
[
DS/Syby
]
[已完结]
500金币求助MOE2010的下载链接
(4/917)
gundnir
2012-03-30
2012-03-31 12:50:07
by
gundnir
[
MS
]
[已完结]
MS 分析数据 Angle distribution, Dihedral angle
(0/957)
mengsk
2012-03-31
2012-03-31 12:43:19
by
mengsk
[
MS
]
[已完结]
关于漆酶分子结构中4个铜原子的构型,请各位高手帮帮忙啊
(0/827)
kizikulo
2012-03-31
2012-03-31 10:43:51
by
kizikulo
[
MS
]
[已完结]
关于linux下的MS5.5使用Gateway无法进行计算的求助
(4/907)
xztjhs
2012-03-26
2012-03-30 23:41:14
by
xztjhs
[
专家会诊
]
为什么目前没有实现蛋白与核酸相互作用的分子模拟软件?
(4/1481)
卢圣国
2012-03-29
2012-03-30 19:22:17
by
卢圣国
[
MS
]
[已完结]
请教 分子动力学模拟 氰酸酯树脂的模型
(2/365)
pyy19890619
2012-03-26
2012-03-30 18:55:24
by
itsok
[
Gromacs
]
[已完结]
amber 保存复合物时出错
(3/699)
sunmuer
2012-03-28
2012-03-30 16:50:09
by
sinokang
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
sorption使用的方法
(1/596)
premonkey
2012-03-28
2012-03-30 15:47:23
by
premonkey
[
其他
]
[已完结]
求教 关于在线拉曼光谱分析设备建模
(1/686)
cb40
2012-03-27
2012-03-30 15:30:20
by
leonil
[
其他
]
【求助】这种图是用什么软件画的
(9/2203)
syf0608
2010-05-20
2012-03-30 15:01:34
by
花之无泪
[
DS/Syby
]
[已完结]
MVD新手请教各位大神!
(5/1287)
lai1979
2012-03-07
2012-03-30 11:02:44
by
snow1580
[
专家会诊
]
[已完结]
激发态二氧化氮的辐射光谱
(0/311)
cc198707
2012-03-30
2012-03-30 09:54:20
by
cc198707
[
DS/Syby
]
[已完结]
求模建问题
(2/340)
郝明
2012-03-28
2012-03-30 08:46:51
by
郝明
[
专家会诊
]
[已完结]
金属配位i物,在Dmol3中问题,结构优化等问题?
(0/555)
hth1289
2012-03-29
2012-03-29 23:22:02
by
hth1289
[
MS
]
[已完结]
吸附
(0/333)
雨中树下
2012-03-29
2012-03-29 20:21:04
by
雨中树下
[
MS
]
[已完结]
铁配合物活化分子氧模型
(0/179)
snowbaby13
2012-03-29
2012-03-29 19:57:38
by
snowbaby13
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于lammps模拟结果可视化的问题
(0/607)
smm0528
2012-03-29
2012-03-29 17:50:20
by
smm0528
[
其他
]
被金蛋连砸5次
(评阅+1)
(12/1223)
zxl523
2012-03-27
2012-03-29 15:09:56
by
dengchun14
[
DS/Syby
]
[已完结]
新手求助,如何在DS中做出漂亮的分子与蛋白对接的3D图片?
(1/982)
ddcook
2012-03-22
2012-03-29 12:54:48
by
xiaolangxin
[
MS
]
[已完结]
做一个模拟的酶与抑制剂结合的三D图
(8/1089)
有机化学2005
2012-03-28
2012-03-29 12:47:20
by
blue_cat
[
Gromacs
]
[已完结]
g_angle
(0/179)
memgr
2012-03-29
2012-03-29 10:53:26
by
memgr
[
LAMMPS/
]
[已完结]
请问想要在一个in文件中读取两个data文件应该如何设置这两个文件
(0/620)
mengwuyu
2012-03-29
2012-03-29 10:22:13
by
mengwuyu
[
Gromacs
]
【求助】请教如何使用GROMACS做PMF?
(8/2348)
shengxiang
2011-03-11
2012-03-29 06:08:05
by
476992939
[
MS
]
弥散材料热导率怎么来模拟,用什么模型???
(1/389)
wxz1983
2012-03-27
2012-03-28 22:54:20
by
丁丁1812
[
MS
]
[已完结]
MS中两个模型间如何复制粘贴?
(0/1126)
wesley67
2012-03-28
2012-03-28 21:47:16
by
wesley67
[
其他
]
[已完结]
求助关于相平衡的一篇文章
(0/254)
shaxijiang
2012-03-28
2012-03-28 21:12:27
by
shaxijiang
[
MS
]
[已完结]
新手求助怎么用MS实现分子振动
(0/548)
揍用力
2012-03-28
2012-03-28 20:58:29
by
揍用力
[
Gromacs
]
[已完结]
把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
(3/2050)
sunmuer
2012-03-06
2012-03-28 16:54:56
by
wangyan10
[
DS/Syby
]
求教对接中的问题
(0/173)
liuxiu841027
2012-03-28
2012-03-28 16:37:49
by
liuxiu841027
[
其他
]
分子模拟表征的是物理相互作用还是化学相互作用?
(模拟EPI+1)
(5/1225)
huanghl2010
2012-03-25
2012-03-28 16:03:48
by
guanzhouxmc
[
资源
]
Molegro Molecular Viewer2下载
(6/964)
aqiao
2012-03-27
2012-03-28 16:01:32
by
aqiao
[已完结]
Materials Studio中k-points值的设定
(0/1685)
50065003
2012-03-28
2012-03-28 14:41:36
by
50065003
[
MS
]
[已完结]
atom ID .............
(0/220)
zxl523
2012-03-28
2012-03-28 08:47:16
by
zxl523
[
MS
]
[已完结]
关于“溢出”的问题
(6/744)
江xiao鱼
2012-03-19
2012-03-28 08:23:28
by
973489386
[
Gromacs
]
[已完结]
amber 小分子出错
(2/329)
sunmuer
2012-03-16
2012-03-27 19:54:58
by
minbad
[
MS
]
[已完结]
模拟杂质原子对晶体物性影响
(1/291)
zzfphy
2012-03-27
2012-03-27 19:27:40
by
chaizhm
[
专家会诊
]
[关贴]
关于对同源建模后的结构进行动力学再用于对接的效果
(0/399)
cfmzxf84
2012-03-27
2012-03-27 16:59:40
by
cfmzxf84
[
专家会诊
]
[已完结]
用GOLD对接动力学后的蛋白,出现如下错误,请指教,谢谢
(1/303)
cfmzxf84
2012-03-27
2012-03-27 15:53:28
by
cfmzxf84
[
Gromacs
]
[已完结]
g_sas 怎么区别亲疏水可及表面积
(0/460)
xiaoyingw
2012-03-27
2012-03-27 11:13:59
by
xiaoyingw
[
LAMMPS/
]
[已完结]
funcfl势文件的单位问题
(0/361)
rush7
2012-03-27
2012-03-27 11:01:25
by
rush7
[
Gromacs
]
[已完结]
antechamber是不认磷元素的么
(2/509)
xiaoyuanlong
2012-03-18
2012-03-27 10:08:42
by
超人与小木虫
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD新手求助
(0/297)
linlin9
2012-03-26
2012-03-26 15:46:35
by
linlin9
[
MS
]
[已完结]
复合中心 or 陷阱
(0/1365)
xiaoluoj
2012-03-26
2012-03-26 13:13:48
by
xiaoluoj
[
MS
]
[已完结]
想用MS来研究有机反应羟醛缩合的机理,请问哪位高手能给我提供一下类似文献?
(4/1147)
good---apple
2012-03-25
2012-03-26 11:27:21
by
ti_pn
[
MS
]
[已完结]
MS 动力学计算 步数设置
(
1
2
)
(13/2481)
江xiao鱼
2012-03-23
2012-03-26 11:09:06
by
江xiao鱼
[
其他
]
[已完结]
VMD的显示问题
(0/1178)
lmzxcom1
2012-03-26
2012-03-26 10:32:08
by
lmzxcom1
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD-DREIDING
(0/211)
sdwp1233
2012-03-26
2012-03-26 09:17:58
by
sdwp1233
[
MS
]
[已完结]
quasiclassical trajectory 理论做计算投稿
(1/327)
510528246
2012-03-23
2012-03-25 16:51:42
by
arthur45415
[
CPMD/CP
]
[已完结]
[关贴]
动力学模拟出错
(7/1531)
jianying8996
2011-11-18
2012-03-25 06:42:59
by
jianying8996
[
其他
]
[已完结]
求任意一篇关于Hydrogen bond cut off 是35度,3.5A的文献
(3/448)
dndxwoaini
2012-02-13
2012-03-24 20:12:32
by
q1036210267
[
专家会诊
]
如何实现脂肽类抗生素与其识别的适配子模拟?
(0/387)
lsssgy
2012-03-24
2012-03-24 19:19:23
by
lsssgy
[
MS
]
discover 模拟问题
(3/503)
973489386
2012-03-23
2012-03-24 08:10:40
by
青菜001
[
其他
]
[已完结]
谁知道5-AMT(化学式C2H2N3S2)的结构式
(2/422)
青菜001
2011-10-24
2012-03-24 05:15:16
by
青菜001
[
其他
]
[已完结]
膜蛋白
(0/221)
zyx19840227
2012-03-23
2012-03-23 20:10:11
by
zyx19840227
[
Gromacs
]
gromacs 固定分子内部结构
(2/957)
jessesunlu
2012-03-13
2012-03-23 20:01:09
by
jessesunlu
[
其他
]
考博就是考英语
(14/972)
zxl523
2012-03-21
2012-03-23 16:55:06
by
neu234
[
DS/Syby
]
[已完结]
请教药物设计中的带负电性基团和带正电性基团的概念
(3/2526)
zhenguo86
2012-03-22
2012-03-23 15:22:10
by
leo1252
[
MS
]
[已完结]
动力学计算过程:时间步长、步数一般设置为多少?
(
1
2
)
(10/8629)
江xiao鱼
2012-03-17
2012-03-23 14:28:33
by
meilanjuhao
[
其他
]
Brownian Dynamics code - Brownmove V1.2 Install, Mac OS
(0/319)
qphll
2012-03-23
2012-03-23 14:16:20
by
qphll
[
CPMD/CP
]
【求助】cpmd.x生成出来,但是不能运行,是怎么回事啊?
(评阅+1)
(7/1320)
zyj8119
2010-12-28
2012-03-23 08:24:24
by
yoghurt117
[
Monte C
]
【原创】MAPS中计算自由体积的python程序
(评阅+5)
(2/802)
zyj8119
2010-12-26
2012-03-23 07:14:21
by
qphll
[
MS
]
[已完结]
关于碳纳米管仿真加电场
(2/481)
雨中树下
2012-02-26
2012-03-22 21:35:51
by
杨佳旭
[
Monte C
]
【原创】MAPS中构筑超晶胞的python程序
(评阅+5)
(2/665)
zyj8119
2010-12-26
2012-03-22 18:09:32
by
juwendy
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MS
]
一台机子同时装Material Studio与Discovery Studio的问题
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lq780928
2012-03-22
2012-03-22 16:46:41
by
ts2009
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DS/Syby
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[已完结]
关于蛋白数据库的一点疑问
(4/1361)
蓝紫色玻璃心
2012-03-20
2012-03-22 12:00:53
by
蓝紫色玻璃心
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MS
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求助中
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hjfdgg
2012-03-21
2012-03-22 10:59:12
by
powny
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Gromacs
]
[已完结]
求教怎样实现文献所说的预组装
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tsadaye
2012-03-22
2012-03-22 10:09:26
by
tsadaye
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MS
]
[已完结]
[关贴]
模拟液体吸附,逸度和压力怎么转换
(1/1310)
premonkey
2012-03-13
2012-03-22 09:28:29
by
premonkey
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MS
]
[已完结]
CVFF_aug Ti原子的键参数
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零度不结冰
2012-03-22
2012-03-22 09:14:16
by
零度不结冰
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MS
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[已完结]
DNA数据库
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微笑旅途
2012-03-21
2012-03-21 12:56:22
by
微笑旅途
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版务
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【讨论】分子模拟版版主专家议事厅
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ghcacj
2010-10-18
2012-03-21 09:21:09
by
zzy870720z
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MS
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空间分布函数
(0/655)
973489386
2012-03-20
2012-03-20 20:14:41
by
973489386
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Gromacs
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作用能正负的意义
(0/790)
小白如水
2012-03-20
2012-03-20 18:35:03
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小白如水
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Gromacs
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amber 动力学 Na+ 坐标出错
(0/226)
lanlanok
2012-03-20
2012-03-20 16:45:20
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lanlanok
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MS
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请教一个MS中Polymorph模块的相关问题
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swollow321
2012-03-20
2012-03-20 15:15:38
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swollow321
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Gromacs
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本科新手,NAMD 做分子模拟,学习受阻,求教~~
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947468266
2012-01-25
2012-03-20 14:47:30
by
linlin9
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Gromacs
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[已完结]
借助tcl脚本,VMD可以分析一些特别的分布函数么?
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小白如水
2012-03-20
2012-03-20 12:48:02
by
小白如水
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DS/Syby
]
【分享】非常好的 Autodock/Vina plugin for PyMOL
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sign
2010-04-23
2012-03-20 07:45:04
by
lylyly2006
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DS/Syby
]
DS 2.5 没有 creat 3d-qsar的模块
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sunmuer
2011-12-27
2012-03-20 06:51:08
by
aqiao
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