| 查看: 826 | 回复: 4 | ||
[求助]
AUTODOCK求助
|
|
情况是这样的，我在进行分子对接，然后对接完之后，我查看DLG文件，查看最低能量 LOWEST ENERGY DOCKED CONFORMATION from EACH CLUSTER ___________________________________________________ Keeping original residue number (specified in the input PDBQ file) for outputting. MODEL 99 USER Run = 99 USER Cluster Rank = 1 USER Number of conformations in this cluster = 100 USER USER RMSD from reference structure = 62.221 A USER USER Estimated Free Energy of Binding = -5.94 kcal/mol [=(1)+(2)+(3)-(4)] USER Estimated Inhibition Constant, Ki = 44.53 uM (micromolar) [Temperature = 298.15 K] USER USER (1) Final Intermolecular Energy = -5.94 kcal/mol USER vdW + Hbond + desolv Energy = -5.97 kcal/mol USER Electrostatic Energy = +0.03 kcal/mol USER (2) Final Total Internal Energy = +0.00 kcal/mol USER (3) Torsional Free Energy = +0.00 kcal/mol USER (4) Unbound System's Energy = +0.00 kcal/mol 下划线的三项为什么全变成0了，能解释下为什么吗，因为上一个分子算的时候还不为0呢,是不是我哪操作出错了 [ Last edited by muye1001 on 2011-12-15 at 10:35 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂
已经有8人回复
-
304求调剂
已经有5人回复
-
化学070300 求调剂
已经有28人回复
-
0854求调剂
已经有24人回复
-
收到复试调剂但是去不了
已经有3人回复
-
22408 312求调剂
已经有25人回复
-
294求调剂
已经有14人回复
-
0831生医工第一轮调剂失败求助
已经有18人回复
-
290求调剂
已经有25人回复
-
一志愿沪9，生物学326求调剂
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】请教Autodock结果分析
已经有8人回复
- 【求助】Autodock分析请教
已经有17人回复
- 【求助】高手求助,Autodock4 最后一步无法对接,弄了几天!
已经有7人回复
- 【求助】linux系统怎么安装拨号上网，怎么在linux安装autodock
已经有7人回复
- 【求助】autodock计算的结果重复性不好
已经有9人回复
- 【求助】求助autodock4安装xp下需要何种电脑配置
已经有8人回复
- 【求助】linux下autodock安装不成功
已经有6人回复
- 【求助】AUTODOCK的一个问题
已经有6人回复
- 【求助】关于Autodock的问题
已经有11人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
2楼2011-12-16 13:57:37
arthurii
木虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 3025.8
- 红花: 2
- 帖子: 902
- 在线: 207.3小时
- 虫号: 816600
- 注册: 2009-07-27
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2011-12-21 07:52:04
4楼2011-12-22 08:53:08
chaizhm: 编辑内容 2012-04-02 18:48
|
1 [ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:48 ] |
5楼2012-04-02 17:29:29
5