应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » CPMD/CP2K » 动力学模拟出错
81/1返回列表
查看: 1822  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织

[求助] 动力学模拟出错

小弟在做分子动力学模拟时，出现错误，新手，不知道该怎么修改，请指教！

*************************************************************************
*** 21:10:26 ERRORL2 in qs_mo_types:read_mos_restart_low processor 0  ***
*** err=-300 Incorrect number of atoms in restart file. qs_mo_types.F ***
*** line   1607                                                       ***
*************************************************************************


===== Routine Calling Stack =====

            8 read_mo_set_from_restart
            7 calculate_first_density_matrix
            6 scf_env_initial_rho_setup
            5 init_scf_run
            4 qs_energies_scf
            3 qs_forces
            2 qs_mol_dyn_low
            1 CP2K
CP2K| Incorrect number of atoms in restart file. qs_mo_types.F line   1607
CP2K| Abnormal program termination, stopped by process number 0
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
人人都为幸福而来！将解决问题置于第一！
1楼 2011-11-18 22:06:09
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
我好像是在坐标中删除了两行，那是因为我去掉了两个原子，但怎么把它修正过来？求指教！
赞一下 回复此楼
人人都为幸福而来！将解决问题置于第一！
2楼2011-11-18 22:08:40
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

q1036210267

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-19 09:58:18
jianying8996(金币+5): 谢谢！非常感谢！ 2011-11-19 10:22:42
你检查下 力场文件 ， 是不是和你的xyz文件相匹配。
赞一下(1人) 回复此楼
生活中坚持快乐的原则不改变，学习工作中踏实上进！`~`
3楼2011-11-19 08:54:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
3楼: Originally posted by q1036210267 at 2011-11-19 08:54:59:
你检查下 力场文件 ， 是不是和你的xyz文件相匹配。

是于原子个数相对应的一行命令吗？我没有找到！指教！谢谢了！
赞一下 回复此楼
人人都为幸福而来！将解决问题置于第一！
4楼2011-11-19 10:24:18
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

harbor2010

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-21 13:04:26
是不是和你的xyz文件相匹配。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-11-19 10:51:50
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
5楼: Originally posted by harbor2010 at 2011-11-19 10:51:50:
是不是和你的xyz文件相匹配。

能否具体些？
回复此楼
人人都为幸福而来！将解决问题置于第一！
6楼2011-11-19 13:09:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

q1036210267

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-03-25 08:38:38
jianying8996: 金币+12, ★★★★★最佳答案 2012-03-25 09:43:40
刚看到你的帖子，你说的意思是 你 删除了 xyz 文件 中的两行内容，对吗？
如果是的话，你xyz原子 总数变了，模拟的盒子中原子排列序号也变了，你需要修改下你的初始的模拟的 体系的文件（也就是xyz文件）
赞一下(1人) 回复此楼
生活中坚持快乐的原则不改变，学习工作中踏实上进！`~`
7楼2012-03-25 08:24:21
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
168951楼: Originally posted by q1036210267 at 2012-03-25 08:24:21:
刚看到你的帖子，你说的意思是 你 删除了 xyz 文件 中的两行内容，对吗？
如果是的话，你xyz原子 总数变了，模拟的盒子中原子排列序号也变了，你需要修改下你的初始的模拟的 体系的文件（也就是xyz文件）

谢谢你的回复，我解决这个问题了，就是XYZ文件匹配除了问题，在input中的坐标与其他文件中的坐标要一直才能运行！谢谢！
赞一下 回复此楼
人人都为幸福而来！将解决问题置于第一！
8楼2012-03-25 09:42:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jianying8996 的主题更新
81/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:39 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:15 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:51 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[教师之家] 现代”学阀”该如何界定 +3 iaeyuan 2026-09-19 3/150 2026-09-19 20:52 by 没昵称呀
[基金申请] 国社科系统bug了，是不是要放榜了？ +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[考博] 申博发邮件 +8 Lmengk 2026-09-15 9/450 2026-09-19 09:27 by 中间体超市
[有机交流] 各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？ 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭