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sunmuer

木虫 (小有名气)

[求助] amber 保存复合物时出错

复合物是1k4f-20  出错信息如图
怎么回事呢
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  • 2012-03-28 10:52:06, 153.13 K

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出清水而不染
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syhu_007012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-03-30 20:51:51
sunmuer: 金币+3, ★★★很有帮助, 原子名称没对应好,so。。。 2012-04-01 06:51:55
你这里面有个配体,配体力场参数没做好吧
2楼2012-03-28 14:25:54
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syhu_007012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
sunmuer: 金币+3, ★★★很有帮助, thx 2012-04-01 06:51:19
另外,你的蛋白不是完整的,中间缺失了残基,做动力学之前要先修复
3楼2012-03-28 14:27:34
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sinokang

至尊木虫 (职业作家)

The file contained 9 atoms not in residue templates
这9个原子力场不识别,找用其他软件修复一下,或者自己添加参数
4楼2012-03-30 16:50:09
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