应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 羟基进攻化合物的IRC分析 出错
81/1返回列表
查看: 2253  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

21018060

木虫 (著名写手)

[求助] 羟基进攻化合物的IRC分析 出错

各位前辈们，我是个计算新手，1、在做羟基与一个化合物的反应时，首先进行寻找过渡态寻找，找到之后优化过渡态，优化之后我为了验证寻找到的是否是正确的过渡态，但结果得到的IRC图像过渡态两侧都是化合物上的H原子靠近羟基的过程，是不是出错了啊，正常的irc分析结果是怎么样的呢？？2、要检验过渡态找的是否正确，除了用IRC分析，还有其他方法吗？
请高手指点啊。非常感谢

我现在将我做的一些命令附上，高手们麻烦给看下是否有错啊啊？

扫描健长的命令：
%chk=HFA-scan.chk
%nprocshared=8
%mem=20GB
#p opt=modredundant b3lyp/6-311+g(d,p)  geom=connectivity

过渡态优化的的命令：
%chk=HFA-scan-tsopt.chk
%nprocshared=8
%mem=20GB
#p opt=(ts,calcfc,noeigen,maxcycle=200) freq b3lyp/6-311+g(d,p) geom=connectivity

irc分析的命令：
%chk=HFA-scan-tsopt-irc.chk
%nprocshared=8
%mem=20GB
# irc=calcall b3lyp/6-31+g(d,p) geom=connectivity

谢谢了！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Gaussian

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Tomorrow will be better
1楼 2011-07-12 16:46:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★
21018060(金币+2): 谢谢，让我知道了另一种IRC分析的方法。 2011-07-13 10:30:19
小红豆(金币+2): 谢谢 2011-07-13 19:39:54
首先应该看振动模式是否正确，
其次可以分两次跑irc
#p irc(Forward,calcfc)
#p irc(Reverse,calcfc)
赞一下(1人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2011-07-12 18:09:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★ ★
21018060(金币+2): 谢谢，我会考虑你的建议的，感谢你每次都热心的帮忙，十分感谢！ 2011-07-13 10:31:12
小红豆(金币+3): 谢谢 2011-07-13 19:40:02
irc的方法与基组与找过渡态的统一。你scan都舍得用b3lyp/6-311+g(d,p)了，找irc为什么不也用这个？楼上的方法也可以，就是把irc分成两部分，可以同时计算，节省时间
赞一下(1人) 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
3楼2011-07-12 18:17:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

另外irc没必要calcall，calcfc即可。甚至直接读你找过渡态的chk，然后rcfc即可，可以节省很多的时间
赞一下 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
4楼2011-07-12 18:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
呵呵。老狼也是个中高手啊。。不错不错。
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2011-07-12 21:31:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2011-07-12 21:31:50:
呵呵。老狼也是个中高手啊。。不错不错。

6楼2011-07-13 12:26:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

majun04

木虫 (著名写手)

majun

【答案】应助回帖

21018060(金币+1): 非常感谢，对我很有用。 2011-07-13 20:08:13
对于过渡态先用小基组粗找，然后再用中等基组找到过渡态以后，在同样的基组下，调用过渡态的check文件，用同样的基组跑IRC。验证过渡态正确了以后，再用大的基组计算能量。
小基组找到的过渡态很可能不准确，但是可以节省好多计算时间。
赞一下 回复此楼
乐观、执着、勤奋
7楼2011-07-13 15:57:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

复归于海

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 18:19:02
另外irc没必要calcall，calcfc即可。甚至直接读你找过渡态的chk，然后rcfc即可，可以节省很多的时间

你好，请问在做出过渡态之后，做IRC时怎么从CHK文件中调用数据？ 做计算的时间不长，在做IRC时我为了保证程序能正常运行下去我都是没有从CHK文件中调用的。
赞一下 回复此楼
澄净
8楼2014-08-31 10:42:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 21018060 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 03:31 by xxniao123
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 3/150 2026-08-26 23:21 by young90
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭