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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 用gaussview5.0.8打开out文件出错，不明白什么意思
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undergoer

铁虫 (正式写手)

[求助] 用gaussview5.0.8打开out文件出错，不明白什么意思

只算完成了我直接用gaussview打开out文件，不行；显示有错误，如下；是什么原因？

然后我看了out文件，里面是这么写的，
Symbolic Z-matrix:
End of file in GetChg.
Error termination via Lnk1e in /lustrefs/apps/Gaussian-03/g03/l101.exe at Fri Feb 24 16:58:33 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  4.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      7 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

这个说了是什么什么原因出错吗？我不太明白是什么意思。
另外，我想打开chk文件，也是有错误！如下，这个是不是我电脑上软件没有安装完整？

先多谢了！

[ Last edited by undergoer on 2012-2-27 at 23:27 ]
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1楼2012-02-27 23:22:24
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

梦里晓诗

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
还有一种可能哈，gaussview不能识别中文。你想用GVW打开的文件存放的路径必须都是英文命名的，不然也无法打开。
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10楼2012-03-02 10:45:05
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普通回帖

viger87

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-02-28 13:06:00
计算出错，中途终止了，所以gaussview读取会出错。应该是你计算内存不够，如果是windows的会出这种问题是很正常的。
还有：以后想别人回答问你问题最后把输入文件贴出来，便于分析...
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有花堪折直须折，末待花落空折枝！
2楼2012-02-28 11:06:52
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undergoer

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by viger87 at 2012-02-28 11:06:52:
计算出错，中途终止了，所以gaussview读取会出错。应该是你计算内存不够，如果是windows的会出这种问题是很正常的。
还有：以后想别人回答问你问题最后把输入文件贴出来，便于分析...

我是在学校的计算中心算的，不是windows上算的，我觉得应该不是内存的问题吧？
多谢了，刚接触这个，提问也是比较生疏，多谢提醒！我用的job文件如下，

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:compute:ppn=4,walltime=48:00:00
#PBS -q long
#PBS -m bea
#PBS -k oe
#PBS -N PbPc_single

export GJF="PbPc_single"
export CHCPath=/lustrefs/projects/AFKO
export LPATH=$PBS_O_WORKDIR
export PATH=/lustrefs/apps/Gaussian-03/bin:$PATH

cd $CHCPath
mkdir $PBS_JOBID
cd $PBS_JOBID
cp $LPATH/* ./

g03 < $GJF.gjf > $GJF.out
cp * $LPATH/

cd ../
rm -r $PBS_JOBID

输入文件的话，是下面这个，
%nprocshared=4
%Chk=PbPc-single.chk
%mem=350MW

# Opt B3LYP/CEP-121G(d,p) Pop=regular Test

PbPc-single

0   1
C  0         -5.3235        -1.6973        -0.2495
C  0         -5.5927        -0.4481        -0.6456
C  0         -4.4853         0.2823        -0.4405
N  0         -3.5862        -0.4818         0.1383
C  0         -4.0603        -1.7033         0.2018
C  0         -0.3111        -3.4514         1.6530
C  0         -1.5805        -3.8106         1.4162
C  0         -2.2337        -2.7251         0.9695
N  0         -1.3563        -1.7985         0.9615
C  0         -0.1923        -2.1478         1.3505
N  0         -3.4557        -2.7316         0.6313
C  0          1.8631         1.6511         0.7377
C  0          2.1471         0.4069         1.1393
C  0          0.9941        -0.2788         1.1444
N  0          0.0236         0.5379         0.8113
C  0          0.5439         1.7011         0.4927
N  0          0.8981        -1.5071         1.4449
C  0         -3.2121         3.4908        -0.8663
C  0         -1.9416         3.8493        -0.6314
C  0         -1.2822         2.7593        -0.2052
N  0         -2.1596         1.8354        -0.2050
C  0         -3.3254         2.1826        -0.5831
N  0         -4.3980         1.5199        -0.7047
N  0         -0.0522         2.7494         0.0990
C  0          2.8247         2.5760         0.6210
C  0          4.0850         2.2180         0.9216
C  0          4.3703         0.9652         1.3205
C  0          3.4014         0.0399         1.4309
C  0          0.5850        -4.3390         2.1045
C  0          0.1747        -5.6013         2.3165
C  0         -1.0994        -5.9613         2.0787
C  0         -1.9941        -5.0677         1.6232
C  0         -4.1111         4.3800        -1.3081
C  0         -3.7037         5.6451        -1.5087
C  0         -2.4291         6.0048        -1.2730
C  0         -1.5305         5.1084        -0.8308
C  0         -6.2342        -2.6728        -0.3594
C  0         -7.4367        -2.3566        -0.8702
C  0         -7.7099        -1.0996        -1.2646
C  0         -6.7869        -0.1278        -1.1601
Pb  0         -1.5359        -0.2078        -0.4839
H  0          2.5951         3.5993         0.2839
H  0          4.8964         2.9602         0.8331
H  0          5.4125         0.6914         1.5564
H  0          3.6357        -0.9873         1.7525
H  0          1.6298        -4.0479         2.2977
H  0          0.8932        -6.3512         2.6885
H  0         -1.4147        -7.0032         2.2579
H  0         -3.0363        -5.3656         1.4268
H  0         -5.1551         4.0873        -1.5030
H  0         -4.4246         6.3969        -1.8721
H  0         -2.1161         7.0485        -1.4451
H  0         -0.4869         5.4050        -0.6395
H  0         -6.0084        -3.7029        -0.0412
H  0         -8.2073        -3.1396        -0.9705
H  0         -8.7019        -0.8635        -1.6856
H  0         -7.0084         0.8985        -1.4936
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3楼2012-02-28 15:39:26
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viger87

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

%mem=350MW

# Opt B3LYP/CEP-121G(d,p) Pop=regular Test
这里中间不空行
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有花堪折直须折，末待花落空折枝！
4楼2012-02-28 19:12:26
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undergoer

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by viger87 at 2012-02-28 19:12:26:
%mem=350MW

# Opt B3LYP/CEP-121G(d,p) Pop=regular Test
这里中间不空行

你好，我试了，都不行，我这两天在问管理员，先谢了！
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5楼2012-03-01 20:57:42
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undergoer

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by viger87 at 2012-02-28 19:12:26:
%mem=350MW

# Opt B3LYP/CEP-121G(d,p) Pop=regular Test
这里中间不空行

对了，在问问为什么GaussView在打开chk文件时，会显示“cant find Gaussian formchk utility”？
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6楼2012-03-01 21:13:31
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lixxxd

银虫 (小有名气)
在命名中加上noeigentest，再算看看了，可能就可以了。但是结果可能会失去对称了。
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认真做事，踏实做人
7楼2012-03-01 22:54:03
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把坐标中那一列0去掉试试。
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8楼2012-03-02 00:13:51
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undergoer

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Jasminer at 2012-03-02 00:13:51:
把坐标中那一列0去掉试试。

试过了，还是不行，自己不太懂，所以也不太能改这些代码什么的，只能是你们说一些我改着试试了；不过还是多谢了！
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9楼2012-03-02 03:30:11
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