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undergoer

铁虫 (正式写手)

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[求助] 用gaussview5.0.8打开out文件出错，不明白什么意思

只算完成了我直接用gaussview打开out文件，不行；显示有错误，如下；是什么原因？

然后我看了out文件，里面是这么写的，
Symbolic Z-matrix:
End of file in GetChg.
Error termination via Lnk1e in /lustrefs/apps/Gaussian-03/g03/l101.exe at Fri Feb 24 16:58:33 2012.
Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 4.7 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 7 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1

这个说了是什么什么原因出错吗？我不太明白是什么意思。
另外，我想打开chk文件，也是有错误！如下，这个是不是我电脑上软件没有安装完整？

先多谢了！

[ Last edited by undergoer on 2012-2-27 at 23:27 ]

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1楼2012-02-27 23:22:24

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undergoer

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引用回帖:

2楼: Originally posted by viger87 at 2012-02-28 11:06:52:
计算出错，中途终止了，所以gaussview读取会出错。应该是你计算内存不够，如果是windows的会出这种问题是很正常的。
还有：以后想别人回答问你问题最后把输入文件贴出来，便于分析...

我是在学校的计算中心算的，不是windows上算的，我觉得应该不是内存的问题吧？
多谢了，刚接触这个，提问也是比较生疏，多谢提醒！我用的job文件如下，

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:compute:ppn=4,walltime=48:00:00
#PBS -q long
#PBS -m bea
#PBS -k oe
#PBS -N PbPc_single

export GJF="PbPc_single"
export CHCPath=/lustrefs/projects/AFKO
export LPATH=$PBS_O_WORKDIR
export PATH=/lustrefs/apps/Gaussian-03/bin:$PATH

cd $CHCPath
mkdir $PBS_JOBID
cd $PBS_JOBID
cp $LPATH/* ./

g03 < $GJF.gjf > $GJF.out
cp * $LPATH/

cd ../
rm -r $PBS_JOBID

输入文件的话，是下面这个，
%nprocshared=4
%Chk=PbPc-single.chk
%mem=350MW

# Opt B3LYP/CEP-121G(d,p) Pop=regular Test

PbPc-single

0 1
C  0       -5.3235       -1.6973       -0.2495
C  0       -5.5927       -0.4481       -0.6456
C  0       -4.4853       0.2823       -0.4405
N  0       -3.5862       -0.4818       0.1383
C  0       -4.0603       -1.7033       0.2018
C  0       -0.3111       -3.4514       1.6530
C  0       -1.5805       -3.8106       1.4162
C  0       -2.2337       -2.7251       0.9695
N  0       -1.3563       -1.7985       0.9615
C  0       -0.1923       -2.1478       1.3505
N  0       -3.4557       -2.7316       0.6313
C  0       1.8631       1.6511       0.7377
C  0       2.1471       0.4069       1.1393
C  0       0.9941       -0.2788       1.1444
N  0       0.0236       0.5379       0.8113
C  0       0.5439       1.7011       0.4927
N  0       0.8981       -1.5071       1.4449
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C  0       -1.9416       3.8493       -0.6314
C  0       -1.2822       2.7593       -0.2052
N  0       -2.1596       1.8354       -0.2050
C  0       -3.3254       2.1826       -0.5831
N  0       -4.3980       1.5199       -0.7047
N  0       -0.0522       2.7494       0.0990
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H  0       2.5951       3.5993       0.2839
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