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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】formchk出错
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越走越远

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】formchk出错 已有7人参与

最近在Unix上转换chk文件时老出错，最后总出现这么几行
   Error termination in NtrErr
   NtrErr Called from FileIO
   Aborted
我上网查了一下，有人说是内存不足，然后分割了一下rwf文件，结果还是转换不成功，麻烦各位帮帮忙，指点一下吧！谢谢！
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吃得苦中苦，方为人上人
1楼 2010-06-09 16:06:56
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越走越远

铜虫 (正式写手)
同志们赶紧帮帮忙，我头都快大了。。。。。。
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吃得苦中苦，方为人上人
2楼2010-06-09 17:05:17
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢提示 2010-06-09 17:58:39
执行命令
export GAUSS_MEMDEF=800000000
然后再运行formchk应该可以过去。

详细内容参见本版置顶Gaussian FAQ贴的第2.13节
贴子地址
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146&fpage=1
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
3楼2010-06-09 17:41:43
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越走越远

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2010-06-09 17:41:43:
执行命令
export GAUSS_MEMDEF=800000000
然后再运行formchk应该可以过去。

详细内容参见本版置顶Gaussian FAQ贴的第2.13节
贴子地址
[url]http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146&fpage=1[ ...

还是不行！！！输入“export GAUSS_MEMDEF=800000000”有提示不？还是再算一遍再formchk？
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吃得苦中苦，方为人上人
4楼2010-06-09 19:41:50
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越走越远

铜虫 (正式写手)
对了，我改到1000000000也不行，难道还小吗？
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吃得苦中苦，方为人上人
5楼2010-06-09 19:52:15
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
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aylayl08(金币+2):谢谢 2010-06-12 10:14:40
应该是执行了export GAUSS_MEMDEF=xxxxx
再执行formchk

如果你知道你的机器的内存大小的话，可以设置比内存稍小一点数值
比如你有8G内存，可以设置
export GAUSS_MEMDEF=7000000000
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
6楼2010-06-09 20:38:20
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越走越远

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2010-06-09 20:38:20:
应该是执行了export GAUSS_MEMDEF=xxxxx
再执行formchk

如果你知道你的机器的内存大小的话，可以设置比内存稍小一点数值
比如你有8G内存，可以设置
export GAUSS_MEMDEF=7000000000

我试了，不是还出现上面那两行，就是出现下面几行
Read checkpoint file b3321opt.chk
Write formatted file b3321opt.fchk
galloc:  could not allocate memory.
galloc:  could not allocate memory.: Cannot allocate memory
Aborted
那个数总是不合适，头都大了，好像是系统有问题，我在另一台机子上formchk的两个算例都成功了！
麻烦你了，跟着我头大！！！
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吃得苦中苦，方为人上人
7楼2010-06-10 16:22:31
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
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aylayl08(金币+2):谢谢 2010-06-12 10:14:50
你这个错误明显是定义的内存太大了，至少比你电脑的内存大
所以这么看来你还不知道你的机器有多大内存

根据你的描述，你把chk文件拷到能行的机器上试试看
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
8楼2010-06-10 17:53:43
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
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heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-06-12 10:51:02
把 你所用的gaussian 版本计算的formchk 程序拷到你计算的文件夹中 执行./formchk *.chk   一定保证要计算用的gaussian 版本 与用的formchk 是同一个版本
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9楼2010-06-11 15:54:05
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越走越远

铜虫 (正式写手)
★
heyo_123(金币+1):谢谢参与！！ 2010-06-13 17:55:17
引用回帖:
Originally posted by chuchu6816 at 2010-06-11 15:54:05:
把 你所用的gaussian 版本计算的formchk 程序拷到你计算的文件夹中 执行./formchk *.chk   一定保证要计算用的gaussian 版本 与用的formchk 是同一个版本

噢，谢谢啦！不是formchk *.chk *.fchk吗，前面还有加./吗？
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吃得苦中苦，方为人上人
10楼2010-06-12 09:06:02
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