应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 关于对同源建模后的结构进行动力学再用于对接的效果
11/1返回列表
查看: 456  |  回复: 0
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[交流] 关于对同源建模后的结构进行动力学再用于对接的效果

动力学的结果就一定好于之前吗？

我同源建模了一个蛋白质结构，用于对接，得到的结果与文献报道一致（实验测定），但是有一些残基的扭转确实不太好。于是我用该结构跑了15ns的动力学，得到的结果用于对接，竟然结果很差。
动力学应该得到的是结合最好的构象，为何会出现这样情况呢？

P.S 动力学的时候，我用的是对接后复合物的结构来跑的···
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-03-27 16:59:40
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
相关版块跳转 我要订阅楼主 cfmzxf84 的主题更新
11/1返回列表
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭