应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 动力学计算过程：时间步长、步数一般设置为多少？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 8776  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

江xiao鱼

铁虫 (小有名气)

[求助] 动力学计算过程：时间步长、步数一般设置为多少？

动力学计算过程：时间步长、步数一般设置为多少？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MD分子动力学 有用的

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Persistence is the victory！！
1楼 2012-03-17 14:36:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-03-18 14:46:00
一般情况你都要阅读很多和你相关的参考文献，精度几篇引用次数多的，看看他们的模拟一般都什么时间步长，跑了多久，这才有参考价值。

大家研究的方向，方法都不一样，时间步长都不同，楼上一般0.5fs,我做全原子模拟一般1fs 或者2fs，而做粗粒化模型模拟的时候一般都是 20fs
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2012-03-18 08:43:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sdzjc1988

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-18 08:40:05
这个取决于你模拟的物质，固液气的时间步长都不一样，同是固体也会有区别~我做碳结构都是0.5 fs。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-03-18 02:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-03-20 14:17:11
时间步长是根据分子振动或转动频率来确定的，陈正隆的《分子模拟的理论与实践》有介绍。

步数的话，可以先试一下。因为分子模拟没有很明确的中断条件，所以只要步数能使系统收敛就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
壁立万仞，无欲则刚
7楼2012-03-20 09:31:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

江xiao鱼

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sdzjc1988 at 2012-03-18 02:22:56:
这个取决于你模拟的物质，固液气的时间步长都不一样，同是固体也会有区别~我做碳结构都是0.5 fs。

恩，谢谢~~这个步长是计算得到的？
赞一下 回复此楼
Persistence is the victory！！
4楼2012-03-19 17:16:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

江xiao鱼

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-03-18 08:43:11:
一般情况你都要阅读很多和你相关的参考文献，精度几篇引用次数多的，看看他们的模拟一般都什么时间步长，跑了多久，这才有参考价值。

大家研究的方向，方法都不一样，时间步长都不同，楼上一般0.5fs,我做全原子 ...

恩，我查的相关文献，只有大概的方法，木有具体参数设置方面的信息，我做的无机盐溶液体系，用的1fs现在，不过我也做过0.5fs、1.2fs，跑出来的结果感觉也没什么太大的改变.
赞一下 回复此楼
Persistence is the victory！！
5楼2012-03-19 17:19:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sdzjc1988

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 江xiao鱼 at 2012-03-19 17:16:26:
恩，谢谢~~这个步长是计算得到的？

这个算是经验吧，我们实验室搞碳模拟都是用这个时间步，得出的结果很理想
赞一下 回复此楼
6楼2012-03-20 05:27:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六世之爱

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-03-20 14:17:24
设为分子中最小伸缩振动周期的十分之一，一般碳氢的伸缩振动周期最短，是10fs。
PS：只是课上理论教学的时候老师这么说过，具体的还是得参考楼上筒子们的说法，具体看文献
赞一下 回复此楼
8楼2012-03-20 12:18:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

江xiao鱼

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chaizhm at 2012-03-20 09:31:29:
时间步长是根据分子振动或转动频率来确定的，陈正隆的《分子模拟的理论与实践》有介绍。

步数的话，可以先试一下。因为分子模拟没有很明确的中断条件，所以只要步数能使系统收敛就可以了。

一般来说，体系不收敛是不是该增加步数呢？
赞一下 回复此楼
Persistence is the victory！！
9楼2012-03-21 08:42:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

江xiao鱼

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 六世之爱 at 2012-03-20 12:18:41:
设为分子中最小伸缩振动周期的十分之一，一般碳氢的伸缩振动周期最短，是10fs。
PS：只是课上理论教学的时候老师这么说过，具体的还是得参考楼上筒子们的说法，具体看文献

好的，谢谢噢~~
回复此楼
Persistence is the victory！！
10楼2012-03-21 08:43:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 江xiao鱼 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 295求调剂 +10 xndjjj 2026-04-04 10/500 2026-04-05 11:19 by 猪会飞
[考研] 323求调剂（计算机视觉和大模型项目经历） +3 chaoxiicy 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:33 by zhq0425
[考研] 材料工程310专硕调剂 +13 捞捞我…. 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:01 by 来看流星雨10
[考研] 一志愿北京化工大学，初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 324求调剂 +9 想上学求调 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:57 by 果冻大王
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考博] 申博 +7 IQwQl 2026-04-04 7/350 2026-04-04 23:32 by mumin1990
[考研] 求调剂 +7 xzghyuj 2026-04-04 7/350 2026-04-04 22:25 by oooqiao
[考研] 086000生物与医药298调剂求助 +6 元元青青 2026-03-31 8/400 2026-04-04 22:15 by lys0704
[考研] 277求调剂 +4 12A3 2026-04-02 5/250 2026-04-04 20:28 by 蓝云思雨
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
[考研] 281求调剂 +10 aaawhy 2026-04-03 10/500 2026-04-03 21:42 by lbsjt
[考研] 330求调剂 +3 白神呜呼呼 2026-04-02 3/150 2026-04-03 10:15 by 蓝云思雨
[考研] 交通运输考试264分求工科调剂 +4 jike777 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:53 by zllcz
[考研] 285求调剂 +14 AZMK 2026-04-02 14/700 2026-04-02 15:54 by 上九天揽月（好�
[考研] 286分调剂 +20 Faune 2026-03-30 22/1100 2026-04-02 13:24 by clyblh
[考研] 298求B区调剂 +4 zzz，，r 2026-04-02 5/250 2026-04-02 12:17 by 土木硕士招生
[考研] 322求调剂 +5 熹僖XX 2026-03-31 6/300 2026-04-02 10:08 by 求调剂zz
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭