| 查看: 450 | 回复: 0 | ||
[求助]
Discover中怎样用BTCL编程计算两组分子之间的相互作用能
|
|
我现在有一段轨迹，想分析里面的两组分子之间作用能随时间的变化 网上有个例子是这样的 readFile returns the total energy of the ith step # This loop will read all available MD records in the his file for {$i = 1} {[set energy [readFile history frame = $i]] != ""} {incr i} { # We can control which records will be calculated if { $i < 3000 } { # Output the step number to stdout echo $i # Write the calculation results to the output text file puts $file "Step = $i $energy" # Perform the nonbond energy calculation here, # the subsets' names should be changed for a different system EnergyAnalysis pv19,ureum -fid $file # Output a newline puts $file "" } else { break } } 这样的写法不知道对不对？ 我不知道怎么从我的体系中选择两组分子 即 subset，用BTCL语句是怎么写的？ 是不是要用subset define 命令啊？具体怎么写呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
表哥与省会女结婚，父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了
已经有12人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有14人回复
-
江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后
已经有3人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有11人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有10人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有11人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
如何处理自旋计算产生的能带
已经有3人回复
- IgG是一种抗体，那anti IgG呢？
已经有10人回复
- PCR退火温度态度会导致扩增不出目的条带么？
已经有4人回复
- 复试中遇到的一个问题
已经有28人回复
- 分享一篇ATK计算金纳米管（分子修饰）的输运计算
已经有95人回复
- 请问我要计算两个分子之间的相互作用，我想固定其中一个分子
已经有8人回复
- 怎么能用量子化学计算含氮杂环芳香化合物与水分子的相互作用
已经有17人回复
- 分子间的两个苯环之间有Π...Π相互作用两个苯环之间的距离一般是多少
已经有5人回复
- 【讨论】计算3分子体系的相互作用能（1个中性分子+一个阳离子+一个阴离子）
已经有5人回复
- 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势
已经有20人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人