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Discover中怎样用BTCL编程计算两组分子之间的相互作用能
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我现在有一段轨迹，想分析里面的两组分子之间作用能随时间的变化 网上有个例子是这样的 readFile returns the total energy of the ith step # This loop will read all available MD records in the his file for {$i = 1} {[set energy [readFile history frame = $i]] != ""} {incr i} { # We can control which records will be calculated if { $i < 3000 } { # Output the step number to stdout echo $i # Write the calculation results to the output text file puts $file "Step = $i $energy" # Perform the nonbond energy calculation here, # the subsets' names should be changed for a different system EnergyAnalysis pv19,ureum -fid $file # Output a newline puts $file "" } else { break } } 这样的写法不知道对不对？ 我不知道怎么从我的体系中选择两组分子 即 subset，用BTCL语句是怎么写的？ 是不是要用subset define 命令啊？具体怎么写呢？ |
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