应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 请问我要计算两个分子之间的相互作用，我想固定其中一个分子
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
91/1返回列表
查看: 1587  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

woxiangfei

木虫 (文坛精英)

[求助] 请问我要计算两个分子之间的相互作用，我想固定其中一个分子

请问我要计算两个分子之间的相互作用，我想固定其中一个分子，请问在优化结构时该如何输入呀？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

计算MS等 材料计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-03-04 14:57:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

xuhu_11

金虫 (职业作家)
woxiangfei: 回帖置顶 2012-03-05 17:11:13
那就么有办法了。
可以用较笨的办法，在GV-edit-atom selection-expand selection，利用滑块看看你需要固定的原子号，在editplus软件中对应直接改gjf文件了，固定时在待固定直角坐标前添-1，即可
赞一下(1人) 回复此楼
千万别考博！
5楼2012-03-05 16:37:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-03-04 21:09:17
woxiangfei(金币+20): ★★★很有帮助 呵呵，谢谢啦 2012-03-05 12:44:14
如果是用Gaussview的话。Edit->Redundant Corrdinate->左上角add->点选固定的原子->下面选择固定的元素(坐标...)->Ok
赞一下 回复此楼
2楼2012-03-04 16:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woxiangfei

木虫 (文坛精英)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiemin8761 at 2012-03-04 16:43:07:
如果是用Gaussview的话。Edit->Redundant Corrdinate->左上角add->点选固定的原子->下面选择固定的元素(坐标...)->Ok

但这样只能每次选择一个原子呀，能不能一下子选择一个分子呢？
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-05 12:56:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
woxiangfei(金币+2): 呵呵，谢谢啦 2012-03-08 20:40:19
试试用ctrl+点击你所选的原子看看行不行，我没试过
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-05 15:02:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woxiangfei

木虫 (文坛精英)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xuhu_11 at 2012-03-05 16:37:19:
那就么有办法了。
可以用较笨的办法，在GV-edit-atom selection-expand selection，利用滑块看看你需要固定的原子号，在editplus软件中对应直接改gjf文件了，固定时在待固定直角坐标前添-1，即可

我按照您的方法做了，怎么优化时候我想固定的怎么还在动呀。我想固定住这个分子让它作为机体，看其他分子在它上面的吸附情况。但怎么会动呢，还有就是我怎么给您评分呢！
赞一下 回复此楼
6楼2012-03-05 17:40:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuhu_11

金虫 (职业作家)
那再用关键词modredundant,输入文件后用n F(n是待冻结原子号)，坐标必须是内坐标，试试看-
赞一下(1人) 回复此楼
千万别考博！
7楼2012-03-06 09:04:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qyyos

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xuhu_11 at 2012-03-06 09:04:28:
那再用关键词modredundant,输入文件后用n F(n是待冻结原子号)，坐标必须是内坐标，试试看-

冻结原子的这种计算，笛卡尔坐标不可以么？？为什么？能解释一下么？我也在纠结这个问题
赞一下 回复此楼
心有猛虎,细嗅蔷薇.
8楼2012-03-06 09:34:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hrbj999

木虫 (正式写手)

硕士研究生
学习了！
回复此楼
believe in yourself !
9楼2012-03-06 11:00:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 woxiangfei 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 266分，一志愿电气工程，本科材料，求材料专业调剂 +8 哇呼哼呼哼 2026-04-02 9/450 2026-04-05 17:14 by lbsjt
[考研] 328分调剂 +6 门men 2026-04-04 6/300 2026-04-05 13:40 by imissbao
[考研] 358求调剂 +7 秋gk 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:29 by huangmoli
[考研] 电子信息调剂交叉学科有推荐吗 +6 jhtfeybgj 2026-04-01 9/450 2026-04-05 11:13 by 猪会飞
[考研] 085600，321分求调剂 +10 大馋小子 2026-04-04 11/550 2026-04-05 08:25 by 544594351
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 材料调剂 +15 一样YWY 2026-04-01 15/750 2026-04-04 22:23 by hemengdong
[考研] 0854求调剂 +4 assdll 2026-04-03 4/200 2026-04-04 22:17 by hemengdong
[考研] 294求调剂 +6 Grey_Ey 2026-04-02 9/450 2026-04-04 22:07 by hemengdong
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 0835学硕299求调剂 08大类可接受 +5 useryy 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:07 by 蓝云思雨
[考研] 348分环境工程·调剂 +10 吴彦祖24k 2026-04-03 11/550 2026-04-04 14:19 by 无际的草原
[考研] 320求调剂 +5 振—TZ 2026-04-02 5/250 2026-04-03 14:42 by fxue1114
[考研] 313求调剂 +3 ～微微凉～ 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:25 by 啵啵啵0119
[考研] 0710生物学，325求调剂 +3 mkkkkkl 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:48 by Jaylen.
[考研] 085410 一志愿211 22408分数359求调剂 +3 123456789qw 2026-03-31 4/200 2026-04-02 00:06 by 义文wang
[考研] 环境工程调剂 +9 hyzzzzzzz. 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:20 by salamander`
[考研] 一志愿北交材料工程总分358 +5 cs0106 2026-04-01 7/350 2026-04-01 11:45 by wangjy2002
[考研] 070300化学专业279调剂 +10 哈哈哈^_^ 2026-03-31 10/500 2026-03-31 23:13 by liu823948201
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭