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163
164
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专家会诊
MS
LAMMPS/DL_POLY
Gromacs/Amber/NAMD
DS/Sybyl/Autodock
Monte Carlo
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vQZoDrrm7mUF
2026-09-27
刚刚
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其他
]
[已完结]
请教各位有关分子对接的问题
(5/1719)
zlp-lw
2012-12-07
2012-12-09 16:50:52
by
longdlut
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps计算结果xyz文件中每个数字代表的字符长短。
(
1
2
)
(10/2523)
herarysara
2012-12-04
2012-12-09 16:26:55
by
jiangtao9571
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS跑完MD后如何用mm-pbsa的方法计算其结合自由能
(0/538)
zhouzhiguang
2012-12-09
2012-12-09 11:42:29
by
zhouzhiguang
[已完结]
Forcite和Discover力场问题
(5/2174)
yui1946
2012-03-26
2012-12-09 10:54:02
by
愤怒的姿态
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs 运行中出现错误
(2/796)
469187892
2012-10-16
2012-12-08 17:29:07
by
469187892
[
MS
]
[已完结]
利用分子模拟某聚合物分子与Fe3O4表面的相互作用
(7/1188)
沧海扶摇
2012-12-03
2012-12-08 14:20:23
by
fyz_ok
[
Gromacs
]
[已完结]
向各位大神求助!AMBER11 tleap中导入力场出错!
(0/761)
caohao1988
2012-12-08
2012-12-08 14:13:05
by
caohao1988
[
其他
]
[已完结]
MVD 中怎样精确计算配体与受体的亲和力
(0/426)
晴朗1989
2012-12-07
2012-12-07 19:30:25
by
晴朗1989
[
Gromacs
]
[已完结]
grompp无法识别原子类型
(7/2678)
wuhaigang
2012-04-29
2012-12-07 17:42:58
by
tianyueli
[
资源
]
PDB数据库
(7/1450)
qingxueer
2012-12-04
2012-12-07 16:38:39
by
wl507586
[
Hyperch
]
[已完结]
hyperchem中的PM3优化是参数设置问题
(0/803)
邓芳
2012-12-07
2012-12-07 15:57:13
by
邓芳
[
其他
]
【讨论】做分子模拟的,毕业后都做些什么工作?
(
1
2
)
(评阅+1)
(14/2464)
329419741
2010-10-26
2012-12-07 14:05:20
by
yaozhq
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs做全原子模拟时候,突然到MD这一步出错
(6/2482)
zyj8119
2011-04-18
2012-12-07 12:24:11
by
yuanbei1987
[
MS
]
[已完结]
关于ms中forcite模块
(0/4014)
lvboshi
2012-12-07
2012-12-07 11:30:39
by
lvboshi
[
Gromacs
]
[已完结]
g_msd求扩散系数
(1/1435)
zhongyunxia
2012-11-30
2012-12-07 10:22:56
by
明月照清渠
[
Gromacs
]
[已完结]
急!能量最小化出问题
(2/774)
zhongyunxia
2011-12-15
2012-12-07 07:10:34
by
明月照清渠
[
CPMD/CP
]
CP2K steps 步数设置中有没有最大值,求解?
(2/734)
jianying8996
2012-12-06
2012-12-06 19:49:22
by
jianying8996
[
专家会诊
]
[已完结]
有没有过氧化氢类似物?
(0/974)
wangpeng227
2012-12-06
2012-12-06 16:56:29
by
wangpeng227
[
LAMMPS/
]
[已完结]
Lammps 运行错误 求指导
(2/813)
amtili
2012-11-21
2012-12-06 16:48:53
by
jiangtao9571
[
MS
]
[已完结]
如何将纳米粒子与聚合物组装起来
(
1
2
)
(17/2493)
农岚沐
2012-11-29
2012-12-06 11:04:29
by
jolly1987
[
LAMMPS/
]
[已完结]
径向分布函数与团簇结构关系
(5/1787)
longwei1221
2012-12-03
2012-12-06 09:32:50
by
zx2456
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
求论文!未知出自哪里
(3/462)
zxl523
2012-12-05
2012-12-06 07:02:12
by
huilaoshu999
[
ME/Gulp
]
【求助】这种 Stillinger–Weber的势参数怎么在GULP 实现
(评阅+1)
(9/2532)
2235803
2010-10-09
2012-12-05 23:55:51
by
oxox6085
[
专家会诊
]
微米颗粒在水中扩散的分子模拟问题
(6/918)
yaneehan2010
2012-12-03
2012-12-05 22:10:04
by
rafy01
[
MS
]
[已完结]
急!求助!单链DNA立体构型模拟(10个金币)
(1/526)
cona815
2012-12-05
2012-12-05 21:18:19
by
jiaoyixiong
[
MS
]
[已完结]
均方位移
(1/611)
zhaoxinting
2012-12-05
2012-12-05 16:08:01
by
vortex5566
[
Gromacs
]
大家用gromacs做膜蛋白有直接从网上下的没?做什么处理了吗?
(12/1818)
469187892
2012-11-30
2012-12-05 14:29:08
by
469187892
[
MS
]
[已完结]
水合阳离子
(0/1024)
lvboshi
2012-12-05
2012-12-05 12:44:17
by
lvboshi
[
其他
]
【求助】请教均方位移的问题
(评阅-1)
(2/751)
astringent
2010-11-28
2012-12-05 12:36:33
by
568286346
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps 吸附 cnt与ni
(4/2703)
hyliao
2011-05-30
2012-12-05 07:17:20
by
hkuieagle
[
MS
]
[已完结]
用MS中使用CASTEP计算NO能量时出现不收敛情况
(0/1935)
snowbra
2012-12-04
2012-12-04 21:54:49
by
snowbra
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
有机金属结构模拟碰到问题
(1/416)
Lotusan
2012-12-04
2012-12-04 20:43:01
by
Lotusan
[
专家会诊
]
[已完结]
大家计算团簇模型都用哪种软件?
(2/591)
zhouzhouya
2012-05-31
2012-12-04 18:31:21
by
jmsdxyf
[
其他
]
[已完结]
HEX6.3结果分析
(1/771)
kahn8
2012-05-04
2012-12-04 17:33:58
by
起就起
[
MS
]
[已完结]
求助
(4/532)
刘银丽
2012-11-28
2012-12-04 14:36:58
by
Lotusan
[
Gromacs
]
[已完结]
在amber中进行酶与抑制剂的动力学模拟的输入文件
(0/267)
紫漠残星
2012-12-04
2012-12-04 12:50:59
by
紫漠残星
[
MS
]
[已完结]
MS 动力学 设置介电常数问题
(1/568)
nanayalei
2012-11-27
2012-12-04 10:57:11
by
jiangsuxuezi
[
MS
]
[已完结]
求助:compass26,compass27力场资源
(2/1219)
wangzhikun
2012-11-24
2012-12-04 10:49:22
by
fyz_ok
[
MS
]
MS固定晶格问题
(11/1696)
jinlong8937
2012-11-28
2012-12-04 10:41:25
by
tylgd2011
[
MS
]
[已完结]
如何让Amorphous cell 建模时多核运算?
(3/1123)
农岚沐
2012-11-30
2012-12-04 10:39:03
by
tylgd2011
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
lammps与DFTB模拟同一个体系的MD,求教!
(1/624)
herarysara
2012-12-03
2012-12-04 09:47:57
by
herarysara
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs现在可用的力场包含第四周期及以后的元素吗?
(0/476)
cenwanglai
2012-12-04
2012-12-04 09:06:56
by
cenwanglai
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps 双原子分子
(2/796)
yiha
2012-12-03
2012-12-04 08:33:10
by
jiaoyixiong
[
其他
]
散金为paper祈福
(
1
2
)
(50/2533)
wuzhenweipku
2012-08-31
2012-12-04 06:57:14
by
ycyl1989
[
MS
]
[已完结]
求助Materials-Studio5.5 for Linux软件
(2/425)
萱月琪琪
2012-12-03
2012-12-03 23:09:15
by
萱月琪琪
[
其他
]
[已完结]
谁知道Discover 95是怎么回事?
(0/379)
zhangmy1989
2012-12-03
2012-12-03 19:34:30
by
zhangmy1989
[
MS
]
[已完结]
自己模拟了一种新晶体,弱弱的问一句,怎样求晶体的形成能啊??审稿人要的
(0/952)
GTF1902
2012-12-03
2012-12-03 17:46:09
by
GTF1902
[
MS
]
[已完结]
castep中对称性的问题
(3/1520)
zhangmy1989
2012-09-11
2012-12-03 16:47:35
by
zhangmy1989
[
LAMMPS/
]
[已完结]
错误信息解读
(2/631)
WJ-MS
2012-10-29
2012-12-03 12:50:10
by
ustber
[
专家会诊
]
回帖送金币!请问计算离子交换树脂与药物的作用力,最好用什么软件计算!
(24/1580)
lee_xiaofe
2012-05-02
2012-12-03 11:23:47
by
lee_xiaofe
[
资源
]
[已完结]
求现在能够使用的gold软件
(2/767)
tingfengyin
2012-12-01
2012-12-03 01:15:43
by
pkuchemistry
[
DS/Syby
]
[已完结]
为什么用hypogen建的药效团Δcost值总是不合要求?应如何优化?
(0/391)
jerrywang19
2012-12-02
2012-12-02 21:27:55
by
jerrywang19
[
MS
]
[已完结]
建一个石墨烯的无定形盒子 总出错 求帮助
(1/453)
coco207
2012-12-01
2012-12-02 19:49:11
by
许飞
[
专家会诊
]
怎样在CCDC下载分子的三维结构
(0/1063)
shuzhuang
2012-12-02
2012-12-02 14:12:13
by
shuzhuang
[
CPMD/CP
]
[已完结]
如何用CPMD算分子静电势产生的电场
(1/781)
ter20
2012-11-30
2012-12-02 10:29:11
by
z6242948
[
Gromacs
]
gromacs
(1/782)
bigtom999
2012-12-01
2012-12-02 09:33:16
by
jiaoyixiong
[
专家会诊
]
[已完结]
reaxff分子动力学运行报错
(1/596)
wqd198686
2012-11-09
2012-12-02 08:18:45
by
一山
[
专家会诊
]
[已完结]
求助多肽链中判断α-螺旋,β-折叠和无规则卷曲形成的条件
(1/5802)
lzg_129
2012-12-01
2012-12-01 21:49:14
by
yalefield
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps安装求助
(2/818)
yangwenbin99
2012-11-30
2012-12-01 09:00:14
by
yangwenbin99
[
Monte C
]
用【graphene或者nanotube】模拟气体吸附时的处理问题
(1/631)
zhang_jaj
2012-11-29
2012-12-01 08:45:45
by
smx07131301
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps 问题请教
(3/842)
熊猫海棠
2012-11-15
2012-11-30 23:19:27
by
jiangtao9571
[
MS
]
软件计算错误
(2/430)
sq1234
2012-11-26
2012-11-30 21:22:51
by
sq1234
[
专家会诊
]
[已完结]
分子对接的免费软件?
(
1
2
)
(10/2418)
wzmcqingwei
2011-12-07
2012-11-30 19:49:22
by
pkuchemistry
[
Gromacs
]
[已完结]
研究分子顺反异构的分布
(0/340)
mengsk
2012-11-30
2012-11-30 16:48:55
by
mengsk
[
Gromacs
]
[已完结]
分子末端距(回复中不能贴图,必须发新帖)
(1/399)
mengsk
2012-10-23
2012-11-30 16:46:51
by
mengsk
[
Gromacs
]
测分子自己的末端距,而不是和镜像的端点的距离
(2/467)
mengsk
2012-11-29
2012-11-30 16:45:43
by
mengsk
[
资源
]
[已完结]
谁能提供蛋白质1fjs_prep_lig.mae.gz和小分子50ligs.mae这个文件包吗
(0/645)
学员FcTnMx
2012-11-30
2012-11-30 16:23:13
by
qq10081807
[
Gromacs
]
[已完结]
g_dist 算分子末端距
(3/1000)
mengsk
2012-10-22
2012-11-30 16:10:37
by
mengsk
[
Monte C
]
[已完结]
关于towhee软件的一些问题
(2/896)
olivershui
2012-11-29
2012-11-30 15:20:32
by
hxl4054
[
资源
]
[已完结]
肿瘤药物分子设计
(5/1046)
ylp
2012-10-21
2012-11-30 15:10:19
by
ylp
[
Gromacs
]
[已完结]
NH3分子在跑MD的时候键角发生变化,该如何处理啊?
(2/452)
rainson1988
2012-11-30
2012-11-30 14:44:14
by
rainson1988
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs运行出错,求方案,谢谢!!!
(6/2087)
patent
2012-03-04
2012-11-30 13:39:30
by
469187892
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
紧急求助
(1/332)
beerhoomw
2012-11-30
2012-11-30 13:22:09
by
beerhoomw
[
Gromacs
]
[已完结]
用Amber对一个含三条链的体系进行MD后,用VMD取帧,发现三条链被连起来了。怎么回事?
(2/695)
落雁双飞
2012-09-26
2012-11-30 09:57:56
by
mingzezhong
[
专家会诊
]
[已完结]
discover 能量最小化问题
(6/1192)
409702500
2012-11-29
2012-11-30 09:20:57
by
chaizhm
[
专家会诊
]
[已完结]
求解JMatPro软件计算若干疑问
(1/1021)
xiao9xie
2012-11-29
2012-11-30 08:51:11
by
宇宙333
[
Gromacs
]
[已完结]
amber secstruct命令计算蛋白二级结构后该怎么做呀
(2/710)
倩430
2012-11-27
2012-11-30 08:49:44
by
倩430
[
MS
]
[已完结]
分子模拟中的微尺度问题
(模拟EPI+1)
(7/1765)
tlger
2011-08-05
2012-11-30 07:35:12
by
tlger
[
Monte C
]
【讨论】大家对未来GPU在monte carlo中的应用持有什么样的态度(CUDA)?
(
1
2
)
(评阅+2)
(15/2871)
zyj8119
2010-09-11
2012-11-30 07:29:20
by
neoxie
[
DS/Syby
]
[关贴]
sybyl做分子对接,画的小分子对接不成功
(16/4241)
胡成海
2012-11-23
2012-11-29 23:43:05
by
胡成海
[
DS/Syby
]
[已完结]
求高手帮忙准备autodock使用的受体文件
(2/405)
xufund
2012-11-25
2012-11-29 19:31:36
by
xufund
[
DS/Syby
]
[已完结]
我想用SYBYL的对接后的体系去做DS的QM/MM优化模型,跑一个MD?
(4/1036)
zhouzhiguang
2012-10-14
2012-11-29 17:10:02
by
Tavel
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DS/Syby
]
[已完结]
请问在sybyl中 做QSAR 和 CoMFA时哪位 各位大牛能提供个小分子数据库
(1/635)
狂而不且
2012-10-14
2012-11-29 17:06:19
by
Tavel
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DS/Syby
]
[已完结]
怎么用DS寻找蛋白的结合位点或者是活性位点?
(3/4079)
asd724210
2012-10-26
2012-11-29 16:59:09
by
Tavel
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DS/Syby
]
[已完结]
求助SYBYL-X对接,对接后配体名称为molecule name,而不是配体名字
(1/604)
chentg
2012-11-19
2012-11-29 16:46:41
by
Tavel
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其他
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QSAR建模
(2/784)
舟舟鱼
2012-11-28
2012-11-29 10:14:31
by
舟舟鱼
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Gromacs
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[已完结]
position restraints
(3/1249)
mengsk
2012-10-24
2012-11-29 08:38:42
by
469187892
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专家会诊
]
[已完结]
[关贴]
求hcp结构 fortran 或者是c代码
(0/365)
lyw867
2012-11-29
2012-11-29 08:36:25
by
lyw867
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MS
]
[已完结]
[关贴]
紧急求助 如何知道两个分子之间是否有相互作用,用什么软件或仪器能得到!
(8/2232)
空中深海
2012-11-26
2012-11-28 22:49:53
by
空中深海
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MS
]
关于MS的问个问题啊
(33/1961)
liuqiang2270
2012-11-27
2012-11-28 19:52:44
by
sesea7
[
MS
]
[已完结]
relative stabilities
(0/247)
nnwang
2012-11-28
2012-11-28 19:39:29
by
nnwang
[
MS
]
[已完结]
Discover 模块计算热力学性能
(1/410)
liuqiang2270
2012-10-10
2012-11-28 15:57:22
by
liuqiang2270
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MS
]
[已完结]
求MS轨迹文件原子坐标处理方法
(3/1521)
herarysara
2012-11-27
2012-11-28 14:09:02
by
herarysara
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Gromacs
]
[已完结]
运行网上gromacs教程中溶菌酶的例子出错,急求高手解救
(1/837)
mikle苏
2012-09-06
2012-11-28 13:27:52
by
coolyuu
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Gromacs
]
[已完结]
活性中心含双铜的蛋白酶的分子动力学模拟(Amber)
(6/1751)
floon
2012-11-20
2012-11-28 12:41:18
by
lujunyan1118
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LAMMPS/
]
3C- 4H- 6H-SiC的tersoff势的参数都相同么
(1/746)
ilxmc
2012-11-26
2012-11-28 12:16:06
by
xinmaoqin
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其他
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【求助】discover模块在ms批处理的问题
(评阅+1)
(3/1016)
cathy-zhang7777
2010-04-02
2012-11-28 11:48:30
by
夏小莫
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MS
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[已完结]
[关贴]
为什么建模之后,盒子里面的分子中原子都散了。
(4/660)
zxl523
2012-11-26
2012-11-28 09:00:10
by
zxl523
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资源
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[已完结]
求金属水合离子半径数据
(1/1163)
南工大njut
2012-11-27
2012-11-28 08:06:20
by
wyzwyz0088
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DS/Syby
]
[已完结]
求推荐创建pdbqt、gpf文件的在线工具
(4/1311)
xufund
2012-11-23
2012-11-27 22:57:25
by
xufund
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