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amber secstruct命令计算蛋白二级结构后该怎么做呀
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我用amber中secstruct命令计算了蛋白在模拟过程中二级结构随时间的的变化。成功的得到两个文件。其中一个.sum文件内容如下 #ResNum 3-10-Helix alpha-helix PI-Helix parallel-Sheet antip.-Sheet Turn 1 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 2 0.008795 0.000000 0.000000 0.617112 1.012885 1.421850 3 0.010261 0.000000 0.000000 0.546752 0.917606 4.050073 4 0.017590 0.001466 0.000000 0.595125 1.036338 4.011961 5 0.024919 0.002932 0.000000 0.530628 1.049530 3.904956 另外的一个文件部分内容如下显示的是 #time residue 1 residue 2 residue 3 residue 4 0.00 0 0 0 0 0 B B B B B 0 0 0 0 B B B 1.00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 T T b 0 2.00 0 b 0 0 0 b 0 0 0 0 T T T T 0 0 0 3.00 0 0 0 b 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.00 0 0 0 0 0 0 0 B 0 0 0 0 0 0 0 B 0 5.00 0 0 0 0 B b 0 0 0 0 0 0 0 0 B T T 6.00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 T T T 请问如果根据这两个文件做出像文献中那样显示蛋白二级结构随时间的变化，麻烦您详细讲解，跪谢 |
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yulilan
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