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zhongyunxia新虫 (小有名气)
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[求助]
急！能量最小化出问题
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各位，我用gromacs做能量最小化，开始是用的是steep，dt=0.001 nsteps=10000,结果说收敛机器精度但是最大力小于设定的emtol(1000),然后我用cg，结果报错：Fatall error:21 of the 14720 bonded interactions could not calculated because some atom involved moved further apart than the multi-body cut-off distance (1.4nm) or the two_body cut-off distance (1.4nm),see option -rdd,for pairs and tabulated bonds also see option -ddcheck 请求给位高手相助，我感激不尽！ |
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2楼2011-12-15 16:02:56
明月照清渠
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
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- 虫号: 1101813
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- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-12-07 10:10:34