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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子模拟中的微尺度问题
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tlger

金虫 (小有名气)

[求助] 分子模拟中的微尺度问题

我想请教一下，我想用discover模块中的dynamics模拟水滴表面张力以及接触角，使之与试验的结果作对比。因为模拟的液滴直径在纳米级，和试验的有可比性么，有没有微尺度问题啊。
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1楼 2011-08-05 14:29:32
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 八错八错，鼓励~ 2011-08-11 20:33:00
tlger(金币+10): 非常感谢 2011-08-12 12:10:48
有！
搭建理想模型体系，必须说明体系的理想性对真实体系的偏差。基本上每篇严肃的模拟论文都会讨论几个基本的问题： 采样有效性，时间收敛问题和空间收敛问题。采样有效性是指采样模拟的能量守恒不守恒，误差多少；时间收敛是指模拟时间长度对采样平均的影响，空间收敛问题就是你说的size effect.

考察size effect必须建不同大小的盒子进行模拟，看看它对你感兴趣的计算量，比如体积性质，黏度性质，表面张力等等的影响。这样的确是比较麻烦的，但如果前人已经模拟过类似的体系，并进行过讨论，你就可以省略这一步，直接采纳前人的结果。当然，你也需要用这个结论所要求的体系大小。
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2楼2011-08-11 07:17:40
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tlger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ChemiAndy at 2011-08-11 07:17:40:
有！
搭建理想模型体系，必须说明体系的理想性对真实体系的偏差。基本上每篇严肃的模拟论文都会讨论几个基本的问题： 采样有效性，时间收敛问题和空间收敛问题。采样有效性是指采样模拟的能量守恒不守恒，误差多 ...

请问您是回答我提的有关微尺度的问题吗 不过谢谢您的回复 感谢
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3楼2011-08-12 12:04:29
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tlger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ChemiAndy at 2011-08-11 07:17:40:
有！
搭建理想模型体系，必须说明体系的理想性对真实体系的偏差。基本上每篇严肃的模拟论文都会讨论几个基本的问题： 采样有效性，时间收敛问题和空间收敛问题。采样有效性是指采样模拟的能量守恒不守恒，误差多 ...

不好意思 刚才我没理解您的意思  呵呵
我想问一下只能通过建立不同的尺寸互相比较才能知道是否出现微尺度问题吗 ，不能从算法上确定吗？
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4楼2011-08-12 12:09:41
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
你说的微尺度是什么意思？
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5楼2011-08-13 11:03:51
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huixia_03

新虫 (小有名气)
想请教您一个问题，就是你做完DYNAMICS 测接触角是怎么测的呢？
我也在做这个，但是是复制到画图工具上手动画的。觉得这个误差太大了，不太可靠。但又找不到更好的方法。
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6楼2012-04-22 12:39:04
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诗意栖居

木虫 (小有名气)
不知道你还在不在，我现在想模拟计算接触角，想用fortran语言编程实现，目前比较困难的是固液界面张力的计算，不知道能不能给我帮助，谢谢您
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7楼2012-11-28 10:35:12
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tlger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
1667420楼: Originally posted by 诗意栖居 at 2012-11-28 10:35:12
不知道你还在不在，我现在想模拟计算接触角，想用fortran语言编程实现，目前比较困难的是固液界面张力的计算，不知道能不能给我帮助，谢谢您

请看培训教材的80几页好像是 ，有个关于界面模拟的例子
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8楼2012-11-30 10:35:12
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