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怎么用DS寻找蛋白的结合位点或者是活性位点？
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| 如题，谢谢了。。 |
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2楼2012-10-30 14:41:54
wangyan10
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 8272.5
- 散金: 58
- 红花: 4
- 帖子: 368
- 在线: 254.3小时
- 虫号: 1089510
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- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-11-30 09:25:09
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-11-30 09:25:09
| 利用DS中的对接模块进行对接研究时，活性位点的选择，一般有这么几种方法。首先就是完全靠DS软件根据你要研究的化合物的性质，有DS完成对活性位点的猜测，具体是怎么个过程，你可以好好看看DS寻找活性位点的说明书部分（find active site),这种操作之后，会得到很多组活性位点，然后结合你自己对这个化合物活性位点的理解（一般来源于对文献的阅读），选择你想要的活性位点，进行对接。第二种方法，就是你对要进行对接的化合物有很深的了解，文献中明确的指出，某个或者某几个残基，就是构成活性位点的关键残基。这样，你就可以把这几个氨基酸残基选中，然后以它们为活性位点，定义对接球，从而进行下一步的对接计算。 |
3楼2012-10-30 16:17:22
4楼2012-11-29 16:59:09