| 查看: 3822 | 回复: 3 | ||
[求助]
怎么用DS寻找蛋白的结合位点或者是活性位点？
|
| 如题，谢谢了。。 |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂院校信息
已经有4人回复
-
085600材料与化工306
已经有4人回复
-
286求调剂
已经有10人回复
-
328求调剂，英语六级551，有科研经历
已经有9人回复
-
一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂
已经有4人回复
-
286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！
已经有8人回复
-
资源与环境 调剂申请(333分)
已经有5人回复
-
280求调剂
已经有12人回复
-
269专硕求调剂
已经有5人回复
-
材料学硕301分求调剂
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 磷酸化位点突变使蛋白活化
已经有4人回复
- 如何查找一个基因的转录起始位点
已经有4人回复
- 如何定位酶与底物的作用位点
已经有6人回复
- 如何从电子云密度判断反应活性位点？
已经有9人回复
- 求教个专业术语：酶的催化位点和活性位点各指的是什么意思
已经有6人回复
- RGD与整合素的结合位点
已经有5人回复
- 【求助/交流】怎样查询某个酶基因的活性位点
已经有3人回复
- 【求助】请前辈高手帮帮忙
已经有7人回复
- 【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
2楼2012-10-30 14:41:54
wangyan10
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 8272.5
- 散金: 58
- 红花: 4
- 帖子: 368
- 在线: 254.3小时
- 虫号: 1089510
- 注册: 2010-09-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-11-30 09:25:09
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-11-30 09:25:09
| 利用DS中的对接模块进行对接研究时，活性位点的选择，一般有这么几种方法。首先就是完全靠DS软件根据你要研究的化合物的性质，有DS完成对活性位点的猜测，具体是怎么个过程，你可以好好看看DS寻找活性位点的说明书部分（find active site),这种操作之后，会得到很多组活性位点，然后结合你自己对这个化合物活性位点的理解（一般来源于对文献的阅读），选择你想要的活性位点，进行对接。第二种方法，就是你对要进行对接的化合物有很深的了解，文献中明确的指出，某个或者某几个残基，就是构成活性位点的关键残基。这样，你就可以把这几个氨基酸残基选中，然后以它们为活性位点，定义对接球，从而进行下一步的对接计算。 |
3楼2012-10-30 16:17:22
4楼2012-11-29 16:59:09
