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【求助】请前辈高手帮帮忙
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kevinding
至尊木虫
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虫号: 300722
[交流]
【求助】请前辈高手帮帮忙
大家好,我现在想做分子对接方面的,想用dock或者DS之类的软件,想请问能不能有一个蛋白表面的位点的快速搜索,也就是让我的配基自己去找合适的位点,能简单告诉我一下方法吗?谢谢!!
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2010-12-20 12:57:55
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houxuben
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kevinding(金币
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):谢谢参与
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-12-20 22:22:12
kevinding(金币+1): 2010-12-21 00:02:21
楼主说清楚点,对接软件都可以计算结合位点的吧
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2楼
2010-12-20 20:36:04
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kevinding
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Originally posted by
houxuben
at 2010-12-20 20:36:04:
楼主说清楚点,对接软件都可以计算结合位点的吧
可以吗?我新手 比如DOCK或者DS怎么计算呢,有没有一些步骤 教程之类的
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3楼
2010-12-20 21:49:33
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houxuben
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-21 14:36:51
引用回帖:
Originally posted by
kevinding
at 2010-12-20 21:49:33:
可以吗?我新手 比如DOCK或者DS怎么计算呢,有没有一些步骤 教程之类的
论坛里很多DS的教程,视频也有,你可以看一下。dock基本是对接的鼻祖,就是现在用的不太多,linux不好操作呀,我这里有官方教程,可以用留个邮箱发给你
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4楼
2010-12-20 22:59:22
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skee2008
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kevinding(金币
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):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-21 14:37:03
利用SYBYL里的SiteID功能应该是可以的,还有DS它本身就是在蛋白分子表面地毯式搜索的
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5楼
2010-12-21 13:19:44
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houxuben
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zh1987hs(金币+1):thank you 2010-12-21 21:21:53
最好用有配体的蛋白晶体结构,利用自带的配体去确定活性位点~
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6楼
2010-12-21 17:04:37
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tjegg
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kevinding(金币
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-23 15:55:47
InsightII或DS中的affinity也能寻找可能的作用位点。
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7楼
2010-12-22 07:40:30
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kevinding
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Originally posted by
tjegg
at 2010-12-22 07:40:30:
InsightII或DS中的affinity也能寻找可能的作用位点。
那有没有详细一点的教程呢 谢谢
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8楼
2010-12-22 21:54:14
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