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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何将纳米粒子与聚合物组装起来
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coco207

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 10:10:19
我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装，但是都是运行了一段时间之后出现failure，只能得到一个密度严重偏低的大盒子，边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津！

你好，我想问一下，我建立聚合物和填料的时候， Add 添加为什么只能添加上聚合物，但是纳米填料选不出来呢
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只有努力才有收获
11楼2012-11-30 16:06:57
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coco207

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 10:10:19
我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装，但是都是运行了一段时间之后出现failure，只能得到一个密度严重偏低的大盒子，边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津！

建立聚合物和填料的时候， Add 添加为什么只能添加上聚合物，但是填料选不出来呢 求指点
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只有努力才有收获
12楼2012-11-30 16:08:21
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农岚沐

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by coco207 at 2012-11-30 16:08:21
建立聚合物和填料的时候， Add 添加为什么只能添加上聚合物，但是填料选不出来呢 求指点...

我只知道如果是周期性结构的话，在AC是不能添加进去的。你看看它弹出的提示，也许可以判断出原因。
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我听不清，你大声点。
13楼2012-11-30 16:30:29
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coco207

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 16:30:29
我只知道如果是周期性结构的话，在AC是不能添加进去的。你看看它弹出的提示，也许可以判断出原因。...

没有提示。如果单独放一个填料构建无定性盒子，就能选上。但是计算的时候会出现错误，显示AmorphousCellConstruct failed because the constituent molecules contain atoms with unknown forcefield atom types.
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只有努力才有收获
14楼2012-12-01 10:19:11
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jolly1987

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 11:44:25
我试了，可以放进去。只是还有个很严肃的问题：我怎么保证我的粒子跟挖出的空心重合在一起？如果只靠鼠标拖动的话，就算真的做到了，也不能让人信服啊。...

你的粒子会一直固定在一个地方吗？如果不是的话，个人觉得可以人为拖动到那个位置，然后运行结构优化，使整个体系合理。
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15楼2012-12-04 08:36:32
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jolly1987

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 11:09:16
AC里面好像还没涉及到系综的选择吧？请细细指教。

当前的大盒子，边长472，如果封装完成的话，应该只有90.48，

粒子.jpg
...

你是在construction时就失败了，是吗？那没有涉及系宗，到Dynamic才有。排除纳米粒子直接封装聚合物链也会失败吗？如果这个能够成功，那先建这个，然后再将纳米粒子复制进去，结果优化应该也可以吧。
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16楼2012-12-04 09:04:28
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农岚沐

金虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by jolly1987 at 2012-12-04 09:04:28
你是在construction时就失败了，是吗？那没有涉及系宗，到Dynamic才有。排除纳米粒子直接封装聚合物链也会失败吗？如果这个能够成功，那先建这个，然后再将纳米粒子复制进去，结果优化应该也可以吧。...

只是封装聚合物的话是没有问题的。

封装好聚合物之后怎么把粒子复制进去？应把粒子拖拉进聚合物里的话，粒子和聚合物不就重合在一起了吗？
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我听不清，你大声点。
17楼2012-12-04 10:02:43
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jolly1987

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
17楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-12-04 10:02:43
只是封装聚合物的话是没有问题的。

封装好聚合物之后怎么把粒子复制进去？应把粒子拖拉进聚合物里的话，粒子和聚合物不就重合在一起了吗？...

我不大了解你们的聚合物材料具体是什么样子的，粒子有多大，完全没有空隙给它吗？不过，不管建好的模型什么样，分子有没有重合，很少有模型一建好就是完美的状态，你试着先结构优化一下，看看能不能调整好。
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18楼2012-12-06 11:04:29
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