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1576127095

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因敲除中的一次同源重组问题 已有1人参与

一次同源重组总是重组不上,请大侠赐教一下一次同源重组的注意事项,做不出来很着急
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RuyangHan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
1576127095: 金币+1, ★★★很有帮助 2015-05-14 14:30:02
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励交流! 2015-05-15 08:48:18
不太懂你的问题。难道不是一次重组能得到很多菌落吗? 二次重组后的突变才不容易获得。
2楼2015-05-14 10:52:42
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1576127095

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by RuyangHan at 2015-05-14 10:52:42
不太懂你的问题。难道不是一次重组能得到很多菌落吗? 二次重组后的突变才不容易获得。

我的做出来都是假阳性,请问可以告诉我你做一次同源重组的具体步骤吗?
3楼2015-05-14 14:32:37
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RuyangHan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 1576127095 at 2015-05-14 14:32:37
我的做出来都是假阳性,请问可以告诉我你做一次同源重组的具体步骤吗?...

我猜你就是这个问题,你是用重组质粒转化,然后用PCR筛选吗? 我是10个中9个假阳性,1个二次重组突变。你也可能都是假阳性,这是没办法控制的。也有可能没有检测出来,PCR检出的假阳性的条带要是很弱,就应该注意是不是背景污染,其实是真的阳性。

假如你不愿意多筛,还可以试试下面两种方法:
1. 把你的重组质粒切开成链状,这样直链DNA片段转化到菌体中,单交换是致死的,没有菌落,获得的菌落都是阳性。问题是大的质粒切开后很长,使转化效率很低。
2. 把质粒中的左右两边同源和抗性基因这一段用PCR扩增出来,大概3-4K,不太长了,用这个片段来做转化,得到的菌落也是只有突变阳性的。
4楼2015-05-15 08:28:54
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