24小时热门版块排行榜    

查看: 4040  |  回复: 6

zdx516

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:本人准备做一个细菌中某个基因的敲除,想用同源重组的方法做

本人想要对细菌的某个基因,进行基因敲除,用同源重组的方法,以接合的方式转化,初次接触,都不懂,请问有做过的大侠么,具体程序,步骤是啥呀,
万分感谢呀
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoxia110

木虫 (正式写手)

同求,有没有相关的书籍或实验手册之类的?
2楼2013-02-20 20:22:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基本设计方法来自Church 1997年的文章
Methods for Generating Precise Deletions and Insertions in the Genome of Wild-Type Escherichia coli: Application to Open Reading Frame Characterization

在其他细菌里,你还需要保证有重组酶,一个反向选择基因可用(sacB在一般Gram-里面都可以),最好有一个在你目标菌中的自杀质粒,一个可以筛选区分e. coli和你的目的菌的办法, 比如某种抗生素能杀e. coli 杀不了你的目标菌

有一个shewanella的protocol,其他也没啥大区别,方法都是一样的
PROTOCOL FOR IN-FRAME DELETION MUTAGENESIS
3楼2013-02-20 22:31:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuxuan

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zdx516: 金币+5 2013-02-24 16:06:55
1、先提取要敲除菌的总DNA
2、设计引物 PCR(构建两个同源臂,就是你要敲除基因的上游系列跟下游系列)
3、然后要找个自杀性载体,讲这两个同源臂连到载体上去(再连个筛选标记)
4、将构建好的载体转化到大肠
5、最后,大肠跟菌株做接合转移
6、长出来的接合子进行筛选  验证
大体应该就这样吧。。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-02-21 10:24:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zdx516

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Haibara_Ai at 2013-02-20 22:31:23
基本设计方法来自Church 1997年的文章
Methods for Generating Precise Deletions and Insertions in the Genome of Wild-Type Escherichia coli: Application to Open Reading Frame Characterization

在其他细 ...

非常感谢,我的菌比较特殊,它是柔膜菌纲,类似于支原体,它能抗卡那,氨苄,只有四环素还可以杀它,还差一个筛选标记,红霉素可以,就是找不到抗性基因。
我不知道我的菌表达不表达重组酶,它基因组中含有l两个重组酶A(recA)基因,这样可以么?一个反向选择基因这是啥?哎,而且我没有自杀质粒,请问可以在质粒PUC19的lacZ位置插入两个同源臂,并在两同源臂之间插入四环素抗性基因,在质粒上再另外加其他起作用的抗生素抗性基因,改成用电转的方法使构建的新质粒转到我的菌中,这样能行吗?
谢谢大侠的帮助
5楼2013-02-24 16:29:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

果园

金虫 (正式写手)

SB

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by chuxuan at 2013-02-21 10:24:39
1、先提取要敲除菌的总DNA
2、设计引物 PCR(构建两个同源臂,就是你要敲除基因的上游系列跟下游系列)
3、然后要找个自杀性载体,讲这两个同源臂连到载体上去(再连个筛选标记)
4、将构建好的载体转化到大肠
...

您好,有具体的实验方法吗?分享个,也要做了,大概原理你说的挺清楚了
OK
6楼2014-11-28 00:47:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guosong0804

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chuxuan at 2013-02-21 10:24:39
1、先提取要敲除菌的总DNA
2、设计引物 PCR(构建两个同源臂,就是你要敲除基因的上游系列跟下游系列)
3、然后要找个自杀性载体,讲这两个同源臂连到载体上去(再连个筛选标记)
4、将构建好的载体转化到大肠
...

你好,我是做链球菌的,想敲掉毒力基因,新入实验室,想尝试这个,但是。。表示很晕。我想问一下:构建好的质粒先转进大肠复制是么?大肠能不能接合转移给链球菌呢?
7楼2015-09-02 12:38:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zdx516 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-24 21:59 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 人气不行了 +10 fansofjerry 2026-08-21 10/500 2026-08-24 21:03 by zhanghaozhu
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见