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zdx516

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:本人准备做一个细菌中某个基因的敲除,想用同源重组的方法做

本人想要对细菌的某个基因,进行基因敲除,用同源重组的方法,以接合的方式转化,初次接触,都不懂,请问有做过的大侠么,具体程序,步骤是啥呀,
万分感谢呀
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chuxuan

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zdx516: 金币+5 2013-02-24 16:06:55
1、先提取要敲除菌的总DNA
2、设计引物 PCR(构建两个同源臂,就是你要敲除基因的上游系列跟下游系列)
3、然后要找个自杀性载体,讲这两个同源臂连到载体上去(再连个筛选标记)
4、将构建好的载体转化到大肠
5、最后,大肠跟菌株做接合转移
6、长出来的接合子进行筛选  验证
大体应该就这样吧。。

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4楼2013-02-21 10:24:39
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xiaoxia110

木虫 (正式写手)

同求,有没有相关的书籍或实验手册之类的?
2楼2013-02-20 20:22:03
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Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基本设计方法来自Church 1997年的文章
Methods for Generating Precise Deletions and Insertions in the Genome of Wild-Type Escherichia coli: Application to Open Reading Frame Characterization

在其他细菌里,你还需要保证有重组酶,一个反向选择基因可用(sacB在一般Gram-里面都可以),最好有一个在你目标菌中的自杀质粒,一个可以筛选区分e. coli和你的目的菌的办法, 比如某种抗生素能杀e. coli 杀不了你的目标菌

有一个shewanella的protocol,其他也没啥大区别,方法都是一样的
PROTOCOL FOR IN-FRAME DELETION MUTAGENESIS
3楼2013-02-20 22:31:23
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zdx516

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Haibara_Ai at 2013-02-20 22:31:23
基本设计方法来自Church 1997年的文章
Methods for Generating Precise Deletions and Insertions in the Genome of Wild-Type Escherichia coli: Application to Open Reading Frame Characterization

在其他细 ...

非常感谢,我的菌比较特殊,它是柔膜菌纲,类似于支原体,它能抗卡那,氨苄,只有四环素还可以杀它,还差一个筛选标记,红霉素可以,就是找不到抗性基因。
我不知道我的菌表达不表达重组酶,它基因组中含有l两个重组酶A(recA)基因,这样可以么?一个反向选择基因这是啥?哎,而且我没有自杀质粒,请问可以在质粒PUC19的lacZ位置插入两个同源臂,并在两同源臂之间插入四环素抗性基因,在质粒上再另外加其他起作用的抗生素抗性基因,改成用电转的方法使构建的新质粒转到我的菌中,这样能行吗?
谢谢大侠的帮助
5楼2013-02-24 16:29:37
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