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三蛰

铜虫 (小有名气)

[求助] 酵母基因敲除,同源臂长度的问题 已有6人参与

我做基因敲除,不太成功,现在考虑是不是我的disruption cassette 的两段的同源臂太短?38bp。必须要大于45bp?我看不少文献都是45bp。。。

[ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 11:57 ]
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我不会!
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15879003030

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-08 19:09:41
三蛰: 金币+2, 有帮助 2014-01-12 21:45:31
我们通常用两三百
2楼2014-01-08 12:36:59
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三蛰

铜虫 (小有名气)

内容已删除
我不会!
3楼2014-01-08 22:37:48
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spirit87

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-01-10 23:22:56
三蛰: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-01-12 21:45:21
酵母一般情况200以上,我们用500左右一直没有问题,某些种200bp效率会低很多
4楼2014-01-10 20:01:28
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三蛰

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by spirit87 at 2014-01-10 20:01:28
酵母一般情况200以上,我们用500左右一直没有问题,某些种200bp效率会低很多

谢谢,我也想长度长点,只是看了不少文献,都是45bp,看来我得增长一点。还有,您能发给我您敲除所依据的文献吗?论文时好引用,谢谢!追加金币嘿嘿
我不会!
5楼2014-01-12 21:45:08
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beer胖

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

一般都500多bp的同源臂,好重组
6楼2014-02-17 10:03:09
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雪人25

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-18 11:50:47
貌似你用的确实太短了,酵母基因敲除一般用300-400 bp的比较合适吧
7楼2014-02-17 15:38:26
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

500-800bp是最佳的片段,希望你考虑一下,没有见这么短的。
8楼2014-02-18 14:32:37
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小猪和哼哼

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
三蛰: 金币+6, 有帮助, 2 2014-09-04 11:13:14
个人半年多的经验,肯定同源臂长点好,但是也别太长,500bp左右我感觉效率可以,好运。
9楼2014-09-03 20:16:47
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chrqrq09

铁虫 (初入文坛)

你用的是酿酒酵母S.cerevisiae吗?这个酵母一般50bp的同源臂就可以,但对于其它的酵母如Yarrowia lipolytica,同源臂1000bp,其定点同源重组的效率还非常的低啊,我做过的1000bp的同源臂,1%的正确同源重组还达不到。
你好
10楼2015-05-11 22:33:59
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