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beescity

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 高度同源的基因做qPCR如何区分？

从模式生物的已知基因在研究对象上找到两份高度同源的基因，只存在个别碱基区别。设计的荧光定量引物总是能对两个基因进行扩增。这种情况应该如何设计引物呢？才能把两个基因区别开？有必要区别开吗？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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1楼 2013-10-05 15:50:54
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beescity

至尊木虫 (著名写手)
自己先顶一下。
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2楼2013-10-05 20:09:25
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-10-06 02:01:57
看看3'-UTR和5'-UTR序列，把引物设计在序列差异大的位置。
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3楼2013-10-06 00:47:38
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beescity

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-06 00:47:38
看看3'-UTR和5'-UTR序列，把引物设计在序列差异大的位置。

做荧光定量，看基因表达的话，做UTR的可行吗？
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4楼2013-10-06 07:47:43
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
beescity: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-10-06 22:42:50
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-10-07 11:50:23
引用回帖:
4楼: Originally posted by beescity at 2013-10-06 07:47:43
做荧光定量，看基因表达的话，做UTR的可行吗？...

可以。UTR虽然不翻译，测mRNA是可以的。
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5楼2013-10-06 11:52:16
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beescity

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-06 11:52:16
可以。UTR虽然不翻译，测mRNA是可以的。...

这样的意思就是，我需要专门下载UTR序列来设计qPCR引物了？
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6楼2013-10-06 22:43:18
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beescity

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-06 11:52:16
可以。UTR虽然不翻译，测mRNA是可以的。...

如果连UTR都高度相似，怎么区分呢？我无语了。居然是这种结果。
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7楼2013-10-06 22:45:14
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xiaoche

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-10-07 11:50:33
3'UTR区域保守性不会那么高吧？可以找一下看看
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8楼2013-10-06 23:06:01
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beescity

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoche at 2013-10-06 23:06:01
3'UTR区域保守性不会那么高吧？可以找一下看看

3-UTR长得差不多，5-UTR有一个多了数十个bp。我准备试试。
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9楼2013-10-06 23:41:56
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by beescity at 2013-10-06 22:45:14
如果连UTR都高度相似，怎么区分呢？我无语了。居然是这种结果。...

先查下序列看看，如果非翻译区的相似度实在非常高就没有办法了。
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10楼2013-10-07 01:35:19
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