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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ayaya007

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教高手--找同源基因的问题

现在已知番茄中一个基因的cDNA序列,但是NCBI上没有登录号,我想找拟南芥和其他植物中的同源基因,跪求高手~~~灰常感谢!
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impact123

禁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
jhu132llh(金币+4, APEPI+1): 鼓励积极应助 2011-12-26 10:15:50
采用电子克隆方法即可,大致操作如下:
1.登录NCBI主页,再点击右侧的BLAST,在Basic BLAST栏目下点击tblastx,打开新的页面
2.将番茄的cDNA序列输入到页面方框中,在Database后面空格中选择“Non-human,non-mouse ESTs(est others),”在Organism后面空格中敲入你准备查询的物种名称,最后点击BLAST,就可以找到
同源基因了。
2楼2011-12-25 23:16:46
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普通回帖

ayaya007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by impact123 at 2011-12-25 23:16:46:
采用电子克隆方法即可,大致操作如下:
1.登录NCBI主页,再点击右侧的BLAST,在Basic BLAST栏目下点击tblastx,打开新的页面
2.将番茄的cDNA序列输入到页面方框中,在Database后面空格中选择“Non-human,non-mo ...

非常感谢!
3楼2011-12-26 21:22:21
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jiaxinfish

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jhu132llh(金币+2): 鼓励积极参与讨论 2011-12-29 10:24:15
除了Non-human,non-mouse ESTs(est others)这个库外,更应该用non redundant 这个库吧,这里基本上都是全长的。ESTs库里一般都是短的Tag
4楼2011-12-26 22:01:58
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