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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 请教高手--找同源基因的问题
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ayaya007

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教高手--找同源基因的问题

现在已知番茄中一个基因的cDNA序列，但是NCBI上没有登录号，我想找拟南芥和其他植物中的同源基因，跪求高手~~~灰常感谢！
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1楼 2011-12-25 22:47:20
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impact123

禁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
jhu132llh(金币+4, APEPI+1): 鼓励积极应助 2011-12-26 10:15:50
采用电子克隆方法即可，大致操作如下：
1.登录NCBI主页，再点击右侧的BLAST，在Basic BLAST栏目下点击tblastx，打开新的页面
2.将番茄的cDNA序列输入到页面方框中，在Database后面空格中选择“Non-human,non-mouse ESTs(est others)，”在Organism后面空格中敲入你准备查询的物种名称，最后点击BLAST，就可以找到
同源基因了。
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2楼2011-12-25 23:16:46
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ayaya007

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by impact123 at 2011-12-25 23:16:46:
采用电子克隆方法即可，大致操作如下：
1.登录NCBI主页，再点击右侧的BLAST，在Basic BLAST栏目下点击tblastx，打开新的页面
2.将番茄的cDNA序列输入到页面方框中，在Database后面空格中选择“Non-human,non-mo ...

非常感谢！
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3楼2011-12-26 21:22:21
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jiaxinfish

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jhu132llh(金币+2): 鼓励积极参与讨论 2011-12-29 10:24:15
除了Non-human,non-mouse ESTs(est others)这个库外，更应该用non redundant 这个库吧，这里基本上都是全长的。ESTs库里一般都是短的Tag
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4楼2011-12-26 22:01:58
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