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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请问高手，怎么确定一个基因的5‘UTR和3'UTR，感谢啦！ 已有3人参与

各位高手，怎么确定一个基因的5’UTR和3'UTR，不胜感激！
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时间是贼，偷走一切……
1楼 2010-12-12 21:59:54
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chentg

木虫 (著名写手)
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rainwander(金币+2):鼓励积极参与~~~ 2010-12-13 00:15:55
有预测它们的软件，具体记不起来了，网上查查。
最笨的办法是首先在基因组上用基因预测软件预测出基因来，然后它们的前后即是。但要分析这些前后的序列要满足相应UTR的特点。特点文献中有。
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我为人人，人人为我。
2楼2010-12-12 23:03:12
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wxf8470

木虫 (小有名气)
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dhd997(金币+1):谢谢交流 2010-12-13 08:57:03
5‘UTR，转录但不翻译的区域，所以你要知道转录起始位点和翻译起始密码。有相关的预测转录起始位点的在线软件，再用软件预测阅读框(ORF)来确定翻译起始密码，通常是ATG。
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3楼2010-12-13 01:02:38
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by chentg at 2010-12-12 23:03:12:
有预测它们的软件，具体记不起来了，网上查查。
最笨的办法是首先在基因组上用基因预测软件预测出基因来，然后它们的前后即是。但要分析这些前后的序列要满足相应UTR的特点。特点文献中有。

谢谢了，我现在有这个基因的外显子序列，而且已经在基因组上比对出来。想找下它的5'和3'侧翼序列的SNP，但是不知道第一个外显子前和最后一个外显子后多少个碱基属于侧翼序列，头疼啊~
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时间是贼，偷走一切……
4楼2010-12-13 10:01:17
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wxf8470 at 2010-12-13 01:02:38:
5‘UTR，转录但不翻译的区域，所以你要知道转录起始位点和翻译起始密码。有相关的预测转录起始位点的在线软件，再用软件预测阅读框(ORF)来确定翻译起始密码，通常是ATG。

谢谢了，我先再找找，还不会再请教您~
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时间是贼，偷走一切……
5楼2010-12-13 10:02:05
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chentg

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
预测转录起始终止的生物信息学软件,在网上都能找到,细细找一下即可.
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我为人人，人人为我。
6楼2010-12-13 11:20:45
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