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zhoulubin

银虫 (小有名气)

[交流] 知道一个基因在花中表达量高有什么用? 已有8人参与

克隆得到一个新的基因,qPCR结果显示在花中含量明显高于其它组织。现在不知道这有什么用,接下来该怎么做。看很多报道有做环境胁迫的,但我这东西长在野外,不好操作。求大神指点一二。
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每个年龄都有其最应该做的事,但只有过了那个年龄自己才知道
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-26 16:36:18
提示你这个基因的功能和开花及生殖有关,可以从这个角度入手分析基因具体功能。这个基因在别的植物,如拟南芥中有没有报道?如果没有相关功能报道,找找拟南芥T-DNA突变体,或做过表达,观察对植物生长尤其是开花影响。扎扎实实把工作做好说不准是一篇好文章。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
2楼2012-06-25 23:27:04
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普通回帖

silicare

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看看具体的功能,表达蛋白的定位,如果和色素及性状相关,通过定点突变可能培养出不同颜色和性状的花✿
3楼2012-06-26 08:44:50
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zhoulubin

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by silicare at 2012-06-26 08:44:50
看看具体的功能,表达蛋白的定位,如果和色素及性状相关,通过定点突变可能培养出不同颜色和性状的花✿

序列比对显示有MYB转录因子功能,只是起调控作用
每个年龄都有其最应该做的事,但只有过了那个年龄自己才知道
4楼2012-06-26 09:10:07
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silicare

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhoulubin at 2012-06-26 09:10:07
序列比对显示有MYB转录因子功能,只是起调控作用...

序列分析只是猜测而已,要靠实验验证,最好的方法就是rnai或敲除
5楼2012-06-26 10:43:58
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starseacow

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhoulubin at 2012-06-26 09:10:07
序列比对显示有MYB转录因子功能,只是起调控作用...

印象里有类似你的情况做的工作发表在BMC Plant Biology上,你可以查查看
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
6楼2012-06-26 16:40:34
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shangjie111

木虫 (正式写手)

灯泡

引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-06-25 23:27:04
提示你这个基因的功能和开花及生殖有关,可以从这个角度入手分析基因具体功能。这个基因在别的植物,如拟南芥中有没有报道?如果没有相关功能报道,找找拟南芥T-DNA突变体,或做过表达,观察对植物生长尤其是开花影 ...

牛人,顶一个
少壮不努力,老大读生技
7楼2012-06-27 16:24:56
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lasting

铁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
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小丹木木: 金币+3, 鼓励交流经验 2012-06-28 15:46:28
做一下序列比对看一下其他植物中有没有序列相似度高的基因,看有没有功能注释。如果具有转录因子domain的话,可以做一下亚细胞定位看看是不是核定位的。最好是有突变体或者过表达的株系,做一些开花相关基因的表达分析。总之,如果是一个新基因,往机制走不动的话,就尽量把表型做的全面一些,也可以发还不错的文章。
8楼2012-06-27 22:26:17
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zhoulubin

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lasting at 2012-06-27 22:26:17
做一下序列比对看一下其他植物中有没有序列相似度高的基因,看有没有功能注释。如果具有转录因子domain的话,可以做一下亚细胞定位看看是不是核定位的。最好是有突变体或者过表达的株系,做一些开花相关基因的表达分 ...

亚细胞定位?如何定位,怎么做?
每个年龄都有其最应该做的事,但只有过了那个年龄自己才知道
9楼2012-06-29 10:15:12
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xiao20020757

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
肯定是和花器官的生长于功能有关的,不然干嘛在花里要高于其他地方
做出点成绩来
10楼2012-06-29 16:04:03
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