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连接载体相关
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明太鱼
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连接载体相关
已有4人参与
最近一直在做连接,持续两个月了,每次都只长假菌落,基因三百多bp,连到了18T上,选择了BanHI和SpeI切(因为没有合适的酶切位点,在基因的非开放读码框处选择了SpeI)并回收,浓度不高大约10纳克左右。
连表达载体,问题就出现了,表达载体上这两个酶切位点距离较近中间只有一个XbaI,不知道是不是这个原因,不论是分别切还是直接双切的都连不上,而且分别切和直接双切后的载体不在一条线上,找了很多办法,为了防止假阳性甚至又将酶切后的载体去磷酸化,假阳性是少了可是没出真的。
用的都是1:3的比例,感受态用的是实验室做的Top10,虽说自己做的可能没有买的好,但是其他同学用也都连上了,我就不知道该怎么办了,请各位大神指点一二。
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1楼
2015-03-29 19:41:44
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木虫
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专业: 生物大分子结构与功能
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楼主载体切不开呀,那你可以换载体试试。
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采菊东篱下,悠然见南山。
9楼
2015-03-30 10:28:05
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xydjlove
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2015-03-30 08:30:14
一般不选择很近的两个酶切位点,会影响酶切效率,刚开始设计引物时,怎么没有引入合适的酶切位点呢?
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活在当下
2楼
2015-03-29 21:51:22
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SAM001
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专业: 微生物资源与分类学
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流
2015-03-30 08:30:17
首先你要做一个对照。就是只加载体,不加片段,再加buffer、酶进行反应,然后转化。看看是否你的载体没有切开,如果载体没切开的话,对照也会长出很多假阳性菌落。
如果一直是假阳性菌落很多,可能你的酶活性不高。可以加大酶切体系的体积,或者换一管酶。
你的T4连接可以常温连接过夜,如果仍然不行,也建议你换一罐T4
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3楼
2015-03-29 23:04:21
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明太鱼
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2楼
:
Originally posted by
xydjlove
at 2015-03-29 21:51:22
一般不选择很近的两个酶切位点,会影响酶切效率,刚开始设计引物时,怎么没有引入合适的酶切位点呢?
刚开始做载体连接,当时还不知道会这样,现在不想改了,已经到连表达载体这步了,只想看看有没有什么方法,可以不换酶切位点的
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4楼
2015-03-30 09:12:27
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