| 查看: 3089 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
基因blast结果分析 已有2人参与
|
||
|
我们项目组正在进行某个果树物种的全基因组测序，基本已经完成。 现在利用在NCBI下载的基因序列，包括拟南芥、番茄等，通过比对获得了我们这个物种的相关基因序列 但是搞不太清下一步我对这些基因怎么进行研究和分析 公司返回的这些数据是要一个一个去拿到NCBI比对，然后找到这条序列对应的是什么基因吧？我怎么能知道具体哪一条序列对的是哪一个基因家族的基因呢？ 下一步是设计引物进行基因的验证吗？是否还要对这些基因进行再测序核对呢？ 我是新手，不要太懂，请多多帮忙啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有186人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何分析测序结果（菜鸟求助）
已经有6人回复
- 如何从转录组测序结果中获取一个基因的序列？
已经有15人回复
- 质粒测序后blast结果分析（菜鸟求助）
已经有15人回复
- 请教，转录组测序与基因组测序结果分析
已经有4人回复
- 基因组测序结果问题
已经有7人回复
- 我扩了某个物种的某个基因，测序结果比对后，我惊呆了
已经有9人回复
- 公司返回DNA双向测序结果要怎么分析
已经有7人回复
- NCBI在线Blast的图文说明
已经有13人回复
- BLAST的使用方法
已经有4人回复
- pcr测序结果分析
已经有15人回复
- 急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因
已经有9人回复
- PCR测序结果分析
已经有8人回复
- 测序结果分析，以及RACE引物设计。求助呢
已经有3人回复
- 基因测序结果比对
已经有5人回复
- 发现了beta actin作为内参的一个漏洞
已经有25人回复
- 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
已经有4人回复
- 转录组数据分析免费软件
已经有11人回复
- 测序结果比对问题
已经有16人回复
- 【交流】Blast比对结果解惑
已经有11人回复
- 【求助/交流】如何用NCBI的BLAST来找到一个基因的保守序列?
已经有11人回复
- 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
已经有17人回复
- 【求助/交流】请教blast结果的解读
已经有6人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tommylike(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-12 20:21:33
tommylike: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-03-13 17:35:00
感谢参与，应助指数 +1
tommylike(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-12 20:21:33
tommylike: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-03-13 17:35:00
| 可以尝试做个进化树，这样可以大致知道你的目的基因与你搜集到的其他物种基因哪个更接近，可以知道你的目的基因属于哪一类。比如说进化树结果可能会显示你的目的基因与某种果树的某种基因属于同一类基因的可能性为90%，然后你再具体分析那种果树基因的功能，这样可以推测出你的目的基因可能具有类似的功能。或者如果是蛋白的数据，有一样道理，用氨基酸序列去做进化树。 |
tommylike4楼2015-03-12 19:18:22
|
就是我现在有这样的一些数据，我该怎么分析呢？这些找到的基因可以直接设计引物pcr吗？是否还需要对这些基因再blast一下 #Query_id Query_length Query_start Query_end Q_align_ratio Strand Subject_id Subject_length Subject_start Subject_end S_align_ratio Score Identity gi|A35021|ACO|Solanum 1080 53 946 0.83 + evm.model.scaffold10873.7 338 26 321 0.88 106 34.64 gi|AK226856|ACO|Arabidopsis 1307 110 1184 0.82 + evm.model.scaffold10873.7 338 13 336 0.96 117 35 |
2楼2015-03-12 14:19:54
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 4
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24644.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
3楼2015-03-12 19:06:07
5楼2015-03-13 17:32:50
40