| 查看: 2911 | 回复: 5 | |||
[求助]
基因blast结果分析 已有2人参与
|
|
我们项目组正在进行某个果树物种的全基因组测序，基本已经完成。 现在利用在NCBI下载的基因序列，包括拟南芥、番茄等，通过比对获得了我们这个物种的相关基因序列 但是搞不太清下一步我对这些基因怎么进行研究和分析 公司返回的这些数据是要一个一个去拿到NCBI比对，然后找到这条序列对应的是什么基因吧？我怎么能知道具体哪一条序列对的是哪一个基因家族的基因呢？ 下一步是设计引物进行基因的验证吗？是否还要对这些基因进行再测序核对呢？ 我是新手，不要太懂，请多多帮忙啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有281人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有2人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何分析测序结果（菜鸟求助）
已经有6人回复
- 如何从转录组测序结果中获取一个基因的序列？
已经有15人回复
- 质粒测序后blast结果分析（菜鸟求助）
已经有15人回复
- 请教，转录组测序与基因组测序结果分析
已经有4人回复
- 基因组测序结果问题
已经有7人回复
- 我扩了某个物种的某个基因，测序结果比对后，我惊呆了
已经有9人回复
- 公司返回DNA双向测序结果要怎么分析
已经有7人回复
- NCBI在线Blast的图文说明
已经有13人回复
- BLAST的使用方法
已经有4人回复
- pcr测序结果分析
已经有15人回复
- 急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因
已经有9人回复
- PCR测序结果分析
已经有8人回复
- 测序结果分析，以及RACE引物设计。求助呢
已经有3人回复
- 基因测序结果比对
已经有5人回复
- 发现了beta actin作为内参的一个漏洞
已经有25人回复
- 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
已经有4人回复
- 转录组数据分析免费软件
已经有11人回复
- 测序结果比对问题
已经有16人回复
- 【交流】Blast比对结果解惑
已经有11人回复
- 【求助/交流】如何用NCBI的BLAST来找到一个基因的保守序列?
已经有11人回复
- 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
已经有17人回复
- 【求助/交流】请教blast结果的解读
已经有6人回复
|
就是我现在有这样的一些数据，我该怎么分析呢？这些找到的基因可以直接设计引物pcr吗？是否还需要对这些基因再blast一下 #Query_id Query_length Query_start Query_end Q_align_ratio Strand Subject_id Subject_length Subject_start Subject_end S_align_ratio Score Identity gi|A35021|ACO|Solanum 1080 53 946 0.83 + evm.model.scaffold10873.7 338 26 321 0.88 106 34.64 gi|AK226856|ACO|Arabidopsis 1307 110 1184 0.82 + evm.model.scaffold10873.7 338 13 336 0.96 117 35 |
2楼2015-03-12 14:19:54
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 4
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
3楼2015-03-12 19:06:07
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tommylike(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-12 20:21:33
tommylike: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-03-13 17:35:00
感谢参与，应助指数 +1
tommylike(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-12 20:21:33
tommylike: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-03-13 17:35:00
| 可以尝试做个进化树，这样可以大致知道你的目的基因与你搜集到的其他物种基因哪个更接近，可以知道你的目的基因属于哪一类。比如说进化树结果可能会显示你的目的基因与某种果树的某种基因属于同一类基因的可能性为90%，然后你再具体分析那种果树基因的功能，这样可以推测出你的目的基因可能具有类似的功能。或者如果是蛋白的数据，有一样道理，用氨基酸序列去做进化树。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
tommylike4楼2015-03-12 19:18:22
5楼2015-03-13 17:32:50
6楼2015-03-13 17:33:32
