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空谈误国

金虫 (正式写手)

潜龙勿用

[求助] qRT-PCR模板量应该加多少? 已有4人参与

我模板cDNA不稀释加 2ul,目的基因CT值35,36,37(平行性一点不好).。。。.β-actin的ct值是18(三个复孔相差0.3以内).
内参挺好说明不是操作的问题,我在想是不是目的基因表达量低,我应该提高模板量至4ul?
但是,我突然想到是不是我模板量加多了导致目的基因CT值不稳定?请问模板量过高会产生这样的不利影响吗?
还是说我应该把模板量提高到4ul,6ul试试?
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logowang

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
空谈误国(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:04:38
一,ct超过32以上就一般不能使用了,问题可能为目的基因表达太低,你可以用普通pcr检测以下你的摸板,是否有基因表达并且引物是否有dimer。确定过后才可上机。
二,内参的选择,你选择的内参在你的实验里显然已经不太适用了,需要重新选择内参,具体你需要查阅文献了,并不是一个内参用到底,不同的实验有不同的要求,你需要一个表达量低的内参 基因,并且控制你的内参和你的目的基因的ct值在10以内(也就是说一个内参高过20,目的低过30。) 这样数值才可靠。

三,最好不要更改体系,变换摸班浓度以稀释为主,不要增添。
4楼2015-01-28 19:04:33
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普通回帖

晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
空谈误国(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:04:25
你用的试剂说明书上会标明你需要使用多大的模板量的。内参正常,目的基因CT值那么高,有可能就是不表达,也有可能是你探针设计的不好,看一下溶解曲线。或者,你说的模板量。再试吧
2楼2015-01-28 16:32:59
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空谈误国

金虫 (正式写手)

潜龙勿用

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-01-28 16:32:59
你用的试剂说明书上会标明你需要使用多大的模板量的。内参正常,目的基因CT值那么高,有可能就是不表达,也有可能是你探针设计的不好,看一下溶解曲线。或者,你说的模板量。再试吧

说明书上模板量写的“Variable”,引物是我师姐从文献里找的,这次提高模板量不行的话,我应该看看引物特异性怎么样。
3楼2015-01-28 18:17:10
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
空谈误国(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:04:46
稀释8-12倍, 然后加样 4-6 ul 就没问题了!
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
5楼2015-01-28 21:58:53
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空谈误国

金虫 (正式写手)

潜龙勿用

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-01-28 16:32:59
你用的试剂说明书上会标明你需要使用多大的模板量的。内参正常,目的基因CT值那么高,有可能就是不表达,也有可能是你探针设计的不好,看一下溶解曲线。或者,你说的模板量。再试吧

谢谢!是引物的问题,我换引物就好了
6楼2015-05-02 14:15:16
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wx3280065

银虫 (小有名气)

考虑引物问题,内参跑18说明引物浓度够了,目的跑35+不知道你一共多少个循环,跑到35+很可能目的基因没有扩增,建议用相同的protocol跑一个普通PCR看看有没有条带。如果引物没有问题那很肯能就是该基因不表达。

发自小木虫Android客户端
7楼2016-02-14 18:10:29
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wx3280065

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wx3280065 at 2016-02-14 18:10:29
考虑引物问题,内参跑18说明引物浓度够了,目的跑35+不知道你一共多少个循环,跑到35+很可能目的基因没有扩增,建议用相同的protocol跑一个普通PCR看看有没有条带。如果引物没有问题那很肯能就是该基因不表达。
...

模板浓度,手误

发自小木虫Android客户端
8楼2016-02-14 18:11:17
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fudan671

木虫 (著名写手)

9楼2016-02-14 19:37:06
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钰乾

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请教一下,也就是说模板浓度高会出现CT值过高的情况,你最后稀释了之后CT值正常了,是这样处理问题的吗?我现在遇到了同样的麻烦。
10楼2016-03-31 07:10:30
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