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peace12039088

银虫 (小有名气)

[交流] 一个基因的cDNA与gDNA 序列有没有可能是完全一样的 已有2人参与

1kb之内的基因的cDNA 与gDNA序列会是完全一致的吗?
例如,基于RT-PCR、PCR分别扩增cDNA/gDNA,测序表明二者序列一致,能就此认为该基因的cDNA/gDNA是完全一致的吗?
望各位资深同行不吝赐教。
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
完全一样还是有的。细菌的基因没有内含子,全都是一样的
2楼2015-01-26 12:03:00
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peace12039088

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-01-26 12:03:00
完全一样还是有的。细菌的基因没有内含子,全都是一样的

我的研究对象是大田农作物。
按照你的意思,若无内含子,就是一样的?
即用同样的引物进行RT-PCR或PCR,得到是序列一致的话,说明是无内含子的,所以cDNA、gDNA是一样的/
3楼2015-01-26 14:58:32
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-01-26 14:58:32
我的研究对象是大田农作物。
按照你的意思,若无内含子,就是一样的?
即用同样的引物进行RT-PCR或PCR,得到是序列一致的话,说明是无内含子的,所以cDNA、gDNA是一样的/...

要用扩增全长的引物把cDNA扩增出来才能确定,要是RT-PCR和PCR引物都是扩增其中一个外显子就说明不了。
4楼2015-01-26 20:06:30
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 感谢应助 2015-02-11 10:27:48
(1)有可能是你的cDNA有gDNA的污染,但一般这种情况你会得到多条带,你应该能注意到。

假设没有污染:
(2)假设你扩的是gene全长,那么你的基因就有可能没有内含子,只有外显子。
(3)如果你扩的只是一部分gene序列,那么就很有可能你刚刚扩出来了同一个外显子片段的序列
5楼2015-01-27 05:53:33
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peace12039088

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-01-27 05:53:33
(1)有可能是你的cDNA有gDNA的污染,但一般这种情况你会得到多条带,你应该能注意到。

假设没有污染:
(2)假设你扩的是gene全长,那么你的基因就有可能没有内含子,只有外显子。
(3)如果你扩的只是一部分 ...

扩增的序列有起始密码与终止密码,说明什么呢
6楼2015-02-10 15:33:49
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peace12039088

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-01-27 05:53:33
(1)有可能是你的cDNA有gDNA的污染,但一般这种情况你会得到多条带,你应该能注意到。

假设没有污染:
(2)假设你扩的是gene全长,那么你的基因就有可能没有内含子,只有外显子。
(3)如果你扩的只是一部分 ...

一个基因的cDNA是否得到了全长,又该如何确定呢?
7楼2015-02-10 15:35:45
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sun_in_night

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-02-09 19:33:49
扩增的序列有起始密码与终止密码,说明什么呢...

你设计引物的时候是从ATG 开始到 TAG的?
8楼2015-02-10 23:54:48
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-02-09 19:35:45
一个基因的cDNA是否得到了全长,又该如何确定呢?...

和数据库比对呀。。。还是说的你作物还没有测序?
9楼2015-02-10 23:55:41
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peace12039088

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-02-10 23:54:48
你设计引物的时候是从ATG 开始到 TAG的?...

是的
10楼2015-02-11 15:22:49
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