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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 一个基因的cDNA与gDNA 序列有没有可能是完全一样的
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peace12039088

银虫 (小有名气)

[交流] 一个基因的cDNA与gDNA 序列有没有可能是完全一样的 已有2人参与

1kb之内的基因的cDNA 与gDNA序列会是完全一致的吗？
例如，基于RT-PCR、PCR分别扩增cDNA/gDNA,测序表明二者序列一致，能就此认为该基因的cDNA/gDNA是完全一致的吗？
望各位资深同行不吝赐教。
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1楼 2015-01-26 11:29:31
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
★
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完全一样还是有的。细菌的基因没有内含子，全都是一样的
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2楼2015-01-26 12:03:00
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peace12039088

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-01-26 12:03:00
完全一样还是有的。细菌的基因没有内含子，全都是一样的

我的研究对象是大田农作物。
按照你的意思，若无内含子，就是一样的？
即用同样的引物进行RT-PCR或PCR，得到是序列一致的话，说明是无内含子的，所以cDNA、gDNA是一样的/
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3楼2015-01-26 14:58:32
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-01-26 14:58:32
我的研究对象是大田农作物。
按照你的意思，若无内含子，就是一样的？
即用同样的引物进行RT-PCR或PCR，得到是序列一致的话，说明是无内含子的，所以cDNA、gDNA是一样的/...

要用扩增全长的引物把cDNA扩增出来才能确定，要是RT-PCR和PCR引物都是扩增其中一个外显子就说明不了。
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4楼2015-01-26 20:06:30
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
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wizardfan: 金币+2, 感谢应助 2015-02-11 10:27:48
（1）有可能是你的cDNA有gDNA的污染，但一般这种情况你会得到多条带，你应该能注意到。

假设没有污染：
（2）假设你扩的是gene全长，那么你的基因就有可能没有内含子，只有外显子。
（3）如果你扩的只是一部分gene序列，那么就很有可能你刚刚扩出来了同一个外显子片段的序列
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5楼2015-01-27 05:53:33
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peace12039088

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-01-27 05:53:33
（1）有可能是你的cDNA有gDNA的污染，但一般这种情况你会得到多条带，你应该能注意到。

假设没有污染：
（2）假设你扩的是gene全长，那么你的基因就有可能没有内含子，只有外显子。
（3）如果你扩的只是一部分 ...

扩增的序列有起始密码与终止密码，说明什么呢
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6楼2015-02-10 15:33:49
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peace12039088

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-01-27 05:53:33
（1）有可能是你的cDNA有gDNA的污染，但一般这种情况你会得到多条带，你应该能注意到。

假设没有污染：
（2）假设你扩的是gene全长，那么你的基因就有可能没有内含子，只有外显子。
（3）如果你扩的只是一部分 ...

一个基因的cDNA是否得到了全长，又该如何确定呢？
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7楼2015-02-10 15:35:45
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-02-09 19:33:49
扩增的序列有起始密码与终止密码，说明什么呢...

你设计引物的时候是从ATG 开始到 TAG的？
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8楼2015-02-10 23:54:48
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by peace12039088 at 2015-02-09 19:35:45
一个基因的cDNA是否得到了全长，又该如何确定呢？...

和数据库比对呀。。。还是说的你作物还没有测序？
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9楼2015-02-10 23:55:41
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peace12039088

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-02-10 23:54:48
你设计引物的时候是从ATG 开始到 TAG的？...

是的
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10楼2015-02-11 15:22:49
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