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dazhen9527

新虫 (小有名气)

[交流] 蛋白纯化有杂带 已有2人参与

目的蛋白83KDa,C端his标签,镍柱纯化过程中,总是在37KDa处伴随一条很亮的杂带,用的BL21表达菌株,pET28a表达载体!请大家多指教!

蛋白纯化有杂带
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justdoit
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董博士

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
dazhen9527: 金币+10 2014-12-29 16:06:51
这个之前我也遇到过,我后来重新用异丙醇以及酒精清洗了柱子,重新摇了菌,并在诱导条件方面控制都很严格,然后10ul上样,1RPM过柱,再用50nM咪唑清洗,6RPM, 之前就是数值一直不变,这次数值变化很大,先增后降,直到稳定,然后400nM洗脱,2RPM,后来跑电泳,结果非常好。楼主可以尝试。
医学&统计学
7楼2014-12-28 21:49:17
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普通回帖
2楼2014-12-25 20:40:43
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

跑非变性胶割胶
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
3楼2014-12-25 22:14:43
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lpzl

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问下楼主,这是摇菌多少体积纯化的?上样量是多少?表达的蛋白是否为包涵体?
Start_everyday_with_a_new_hope,_leave_bad_memories...
4楼2014-12-26 09:04:57
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dazhen9527

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lpzl at 2014-12-26 09:04:57
请问下楼主,这是摇菌多少体积纯化的?上样量是多少?表达的蛋白是否为包涵体?

妖菌100ml,跑电泳上样量10ul,蛋白浓度约为400ug/ml,蛋白可溶
justdoit
5楼2014-12-26 09:12:58
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天际雾影

新虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你可以先用50mM的咪唑洗一下,在用500mM洗脱目的蛋白,可以试试效果。如果杂带减少,还没消失可以再增加一次100mM咪唑洗杂带。
6楼2014-12-28 20:24:42
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dazhen9527

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 董博士 at 2014-12-28 21:49:17
这个之前我也遇到过,我后来重新用异丙醇以及酒精清洗了柱子,重新摇了菌,并在诱导条件方面控制都很严格,然后10ul上样,1RPM过柱,再用50nM咪唑清洗,6RPM, 之前就是数值一直不变,这次数值变化很大,先增后降, ...

谢谢您的详尽回复,我想了解一下出现这种原因,是因为被蛋白酶切割了,还是杂蛋白没去除干净,从图来看,下面的蛋白好像是伴随着上面的目的蛋白一起出现的,好像降解似的
justdoit
8楼2014-12-29 16:08:41
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
dazhen9527: 金币+10, 谢谢,这是一种好建议 2014-12-30 08:30:04
想了解一下出现这种原因,是因为被蛋白酶切割了,还是杂蛋白没去除干净。

只要从胶上把感兴趣的蛋白质带回收,然后测定一下N末端的10左右的氨基酸就可以确定;或者用肽谱分析——用胰蛋白酶分别切割原始蛋白质和杂带蛋白质,对比后者的裂解出的肽段斑是否包括在前者的肽段斑,不过可能有风险,因为可能降解后的蛋白质可能显露出新的酶切位点。也可以酶切后用质谱,对比原始蛋白质和杂带,但是至少对于杂带蛋白质进行局部测序是必要的,因为你并不确定杂蛋白具体有哪些。
9楼2014-12-30 00:42:04
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yakir

银虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Ni柱纯化出来和目的带一样特异的条带,
一.降解:表达时低温诱导表达,破碎时加些蛋白酶抑制剂,全程冰上操作,看看会不会有帮助。
二. 会不会你的表达质粒中混有其他带His的蛋白基因,分子上面要注意点,这个概率还是比较小的,但是小概率事件也是经常发生的。
一步一步!
10楼2014-12-30 16:27:24
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