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95846713

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白表达 超声破碎问题 已有1人参与

本人新手,不知道跑SDS-page时的上清和沉淀具体是哪个?   用(1)(2)(3)(4)中哪2个跑SDS-page?   超声破碎后用不用离心啊?
1.  上清:菌体诱导再离心后的上清(1),   沉淀:菌体离心后沉淀, 再用PBS悬浮,再超声波破碎(2)
2.菌体离心后,PBS重悬,超声波破碎破碎,离心后的上清(3) 和沉淀(4)
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youlinglyw

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
95846713(myprayer代发): 金币+5, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-19 11:34:20
一般情况下
跑1 的目的是为了检测你的蛋白是否除了包涵体外,还有可溶部分表达。如果可溶部分表达多的话,那么说不定有活性或者需要收集。毕竟表达不易。不过大部分原核表达都是包涵体了,因为表达速度快,再加上缺乏必要的酶去折叠修饰
跑2的目的,这个一般是用来和1做对比的。证明你的蛋白是在包涵体表达,而不是上清表达。
以上为一栏。可以并列跑,做对比。
跑3的目的是为了检测你的包涵体在超声破碎后已经重新溶解在pbs中,
跑4的目的是为了检测你的包涵体在超声破碎后,依然没有溶解在pbs中,那么你需要用尿素之类的溶解过夜去把蛋白提取出来。
以上为一栏,可以并列跑,作对比,来防止有的蛋白非常容易溶解,你辛辛苦苦把包涵体拿出来,尿素溶解后,却发现,没东西,人家早就溶解到了上清了(这个比较罕见哈,也不排除,生物嘛,没有例外还叫生物啊)
这4个都是有必要跑的。
其中1,2是必须跑得,用来最初证明包涵体表达。在发文章也会用到,而3,4则是用来做方便实验的。
因为蛋白的种类多,条件也复杂。等电点等稍微的差异都会造成溶解不一样。

如果非说要跑的话,2,4是必须跑,事实上,1,2,4都是常见的。而很多人会选择1,2,3,4都跑胶,这样,证据鲜明,对照明显,有说服力。
天行健
2楼2014-11-19 10:16:39
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youlinglyw

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【答案】应助回帖

补充说明
之所以说1,2是必须的,是因为你要告诉对方、
a,我已经成功进行了蛋白表达
b,我表达的蛋白大小是我需要的
c,我表达的蛋白其量是足够我进行下一步操作的,如果在1,2的电泳时候,你发现表达量不够,那么后续根本没必要做。必须优化条件,换菌株,换载体,甚至换片段来获取更高的表达量。蛋白的纯化是非常损耗的,一般能得到20%左右都算很高很高了。
d,我表达的蛋白是存在于包涵体,因此,接下来可以毫无疑问,我的蛋白是缺乏活性的。如果你要做的是有活性的蛋白,那么就要悠着点了,很多时候,用酵母表达,表达蛋白需存在于上清,才有活性。包涵体是没活性的。
天行健
3楼2014-11-19 10:22:12
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95846713

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-11-19 10:22:12
补充说明
之所以说1,2是必须的,是因为你要告诉对方、
a,我已经成功进行了蛋白表达
b,我表达的蛋白大小是我需要的
c,我表达的蛋白其量是足够我进行下一步操作的,如果在1,2的电泳时候,你发现表达量不够,那 ...

谢谢 解释的太透彻了
4楼2014-11-19 10:27:06
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