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ljj0720

银虫 (正式写手)

[求助] 目的蛋白表达纯化,求教高手已有3人参与

最近在做蛋白纯化
一、证明目的蛋白有表达
1、挑取一单菌落接种于含氨苄(Amp,终浓度为100g/mL)的5mL液体 LB培养基中37℃,200rpm培养过夜。
2、将过夜培养菌液以1:100转接于含上述抗生素的50mL液体LB 中,37℃,200rpm,2.5h(大量培养至OD600=0.6左右)。
3、取出2 mL菌液为未诱导的电泳对照,取出2 mL菌液为诱导,加入诱导物IPTG至终浓度为0.5 mmol/L,30度(前期摸索过条件,发现IPTG至终浓度为0.5 mmol/L最好),继续振荡培养4h。
4、诱导的菌液0.01%PBS悬浮,冰上超声破碎,超声10S,停10S,
5、超声上清、沉淀、未诱导各取30微升,加 7.5微升的5*蛋白上样缓冲液, 煮沸7分钟,离心12000rpm, 2min, SDS-PAGE检测。
结果如下:图1

左1: 对照,左2: 超声沉淀,3: 超声上清,4: marker  红色位置是目的蛋白大小位置
从图中可以看出,虽然可溶性蛋白少,但是还是有的,所以想先尝试做可溶性蛋白表达。
二、大量表达的情况
配试剂
1×Ni-NTA 结合缓冲液:(用于裂解和结合步骤)
50mM NaH2PO4,pH 8.0,300mM NaCl,10mM 咪唑
1×Ni-NTA 漂洗缓冲液:50mM NaH2P04,pH 8.0,300mM NaCI,20mM 咪唑
1×Ni-NTA 洗脱缓冲液:50mM NaH2PO4,pH8.0,300mM NaCI,250mM 咪唑


诱导培养:取50微升保存的菌种,加入5微升AMP,加5ML的LB培养基,37℃,200rpm培养过夜。将过夜培养菌液以1:100转接于含上述抗生素的200ML液体LB 中,37℃,200rpm,2.5h(大量培养至OD600=0.6左右)后,培养液加入诱导物IPTG至终浓度为0.5 mmol/L,30℃,200rpm条件下,继续振荡培养4小时。
破 菌收集上清:离心(4℃,12000g,5min),弃上清,加4ML的1*NI-NTA(pH 8.0)缓冲液重悬后,冰浴条件下超声波破碎(400W,10s,10s,15min),离心(4℃,12000g,20min)收集上清。

过镍柱纯化:
1、将1ml 50% Ni-NTA His·Bind树脂悬液加入到4ml 1×Ni-NTA结合缓冲液中,轻柔混匀。待树脂自然沉降
后,用枪头吸去 4ml上清。
2、加入4ml制备好的裂解液,轻柔摇动棍匀,4℃结合60分钟。
3、将裂解液Ni-NTA His·Bind树脂混合物加入下端封闭的空色谱柱中。
4、除去柱下端封闭盖子,离心,2000g,结合5min,离心4min,收集流出液(穿过峰),保存用于SDS-PAGE电泳分析。
5、以4ml 1×Ni-NTA漂洗缓冲液漂洗2次,2000g,结合5min,离心4min,收集漂洗组分,用于SDS-PAGE电泳分析。
6、以0.5 ml 1×Ni-NTA洗脱缓冲液洗脱目的蛋白4次。2000g,结合5min,离心4min,将洗脱组分分为四部分收集,并SDS-PAGE 电泳分
析各保存组分。
结果如图2
左1:marker, 左2:穿透液;左3:漂1;左4:漂2;左5:脱1.....
但是 几乎没有洗脱下来,求教高手
目的蛋白表达纯化,求教高手
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目的蛋白表达纯化,求教高手-1
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-15 15:43:59
第一块上样量太大,且脱色不完全。目的蛋白的位置上可能有其它杂带。确定上清里有多少目的蛋白,可以做个western检测一下。
2楼2013-12-15 13:12:46
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-16 01:21:42
看沉淀里的确有不少目标蛋白。我感觉你的超声破碎不完全,所以沉淀里有很多杂带,来自未破碎的菌体。超声超得好的,沉淀里几乎只有包涵体,杂带会很少。...

恩 但是  超声条件是师姐她们上次做蛋白的时候摸好的条件,我i不知道再换条件,应该换成什么了
10楼2013-12-16 08:25:23
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-15 15:44:07
更大的可能性是全部形成包涵体了,而不是你说的可溶性蛋白少,因为超声上清中对应条带在对照中也有。
3楼2013-12-15 14:16:33
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-15 13:12:46
第一块上样量太大,且脱色不完全。目的蛋白的位置上可能有其它杂带。确定上清里有多少目的蛋白,可以做个western检测一下。

实验室条件有限 不能做western检测 所以 现在很是苦恼
4楼2013-12-15 19:33:31
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-12-15 14:16:33
更大的可能性是全部形成包涵体了,而不是你说的可溶性蛋白少,因为超声上清中对应条带在对照中也有。

但是脱1中还隐隐约约可以看见目的蛋白,现在主要是不能确定能不能做可溶性表达,这是我第一次做可溶性表达的结果,请教一下,我还要你要继续优化条件做可溶性表达吗?
5楼2013-12-15 19:35:19
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-15 13:12:46
第一块上样量太大,且脱色不完全。目的蛋白的位置上可能有其它杂带。确定上清里有多少目的蛋白,可以做个western检测一下。

脱1中还隐隐约约可以看见目的蛋白,现在主要是不能确定能不能做可溶性表达,这是我第一次做可溶性表达的结果,请教一下,我还要你要继续优化条件做可溶性表达吗?
6楼2013-12-15 19:36:50
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ljj0720 at 2013-12-15 19:33:31
实验室条件有限 不能做western检测 所以 现在很是苦恼...

看沉淀里的确有不少目标蛋白。我感觉你的超声破碎不完全,所以沉淀里有很多杂带,来自未破碎的菌体。超声超得好的,沉淀里几乎只有包涵体,杂带会很少。
7楼2013-12-16 01:21:42
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ljj0720 at 2013-12-15 19:36:50
脱1中还隐隐约约可以看见目的蛋白,现在主要是不能确定能不能做可溶性表达,这是我第一次做可溶性表达的结果,请教一下,我还要你要继续优化条件做可溶性表达吗?...

可溶蛋白的确在后续实验中方便很多,你可以试试。不过你的超声条件好像不好。由于有包涵体的干扰,超声的效果不容易看。你可以用一管未诱导的菌做对照。超声后菌液会从浑浊变成半透明。通过降低IPTG浓度和诱导温度有助于增加可溶蛋白。
8楼2013-12-16 01:26:19
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ljj0720 at 2013-12-15 19:35:19
但是脱1中还隐隐约约可以看见目的蛋白,现在主要是不能确定能不能做可溶性表达,这是我第一次做可溶性表达的结果,请教一下,我还要你要继续优化条件做可溶性表达吗?...

可以降低诱导剂浓度和诱导温度试试。
9楼2013-12-16 07:56:36
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