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为什么TA克隆,测序有些不是目的片段,而是大肠杆菌的序列?
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南海所老龚
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为什么TA克隆,测序有些不是目的片段,而是大肠杆菌的序列?
已有1人参与
各位虫友好!
RT,为什么会是大肠杆菌的序列(比对上100%)?难道是载体和大肠杆菌的序列连接上了,所以菌落在氨苄培养基上活了下来?欢迎有经验的虫友谈谈经验。
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1楼
2014-11-12 11:40:00
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wangxl722008
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我前段时间也是,一直没找到原因,只能从头做。
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2014-11-12 11:44:59
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王冠傑
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【答案】应助回帖
★ ★
南海所老龚(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流
2014-11-27 20:03:05
亲:TA克隆的载体一般是PMD19-T(PUC19改造的)或者PGM-Teasy,不知道你用来测序的样本是公司提供的质粒还是菌液,如果是质粒测序的话是不应该出现大肠杆菌序列的,如果是菌液,后期培养过程中可能是被污染了。还有不知道你说的大肠杆菌序列是在哪儿比对的,能把序列发一下嘛?
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3楼
2014-11-27 08:54:38
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王冠傑
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注册: 2013-04-14
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专业: 免疫遗传学
【答案】应助回帖
还有一种可能:你扩增的片段就不对。所以你可以用扩增的片段测个序试试。
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4楼
2014-11-27 08:58:23
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专业: 生物化学
管辖:
分子生物
不知道这个实验是否需要x-gal啊
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人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
5楼
2014-11-27 09:11:21
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