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南海所老龚

新虫 (正式写手)

[求助] 为什么TA克隆,测序有些不是目的片段,而是大肠杆菌的序列? 已有1人参与

各位虫友好!
RT,为什么会是大肠杆菌的序列(比对上100%)?难道是载体和大肠杆菌的序列连接上了,所以菌落在氨苄培养基上活了下来?欢迎有经验的虫友谈谈经验。
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TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
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wangxl722008

铁杆木虫 (著名写手)

我前段时间也是,一直没找到原因,只能从头做。
2楼2014-11-12 11:44:59
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王冠傑

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
南海所老龚(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-11-27 20:03:05
亲:TA克隆的载体一般是PMD19-T(PUC19改造的)或者PGM-Teasy,不知道你用来测序的样本是公司提供的质粒还是菌液,如果是质粒测序的话是不应该出现大肠杆菌序列的,如果是菌液,后期培养过程中可能是被污染了。还有不知道你说的大肠杆菌序列是在哪儿比对的,能把序列发一下嘛?
3楼2014-11-27 08:54:38
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王冠傑

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

还有一种可能:你扩增的片段就不对。所以你可以用扩增的片段测个序试试。
4楼2014-11-27 08:58:23
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

不知道这个实验是否需要x-gal啊
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
5楼2014-11-27 09:11:21
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